176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2292 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  100 
 
 		 239 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  69.13 
 
 		 241 aa  345  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  55.42 
 
 		 245 aa  291  8e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  47.7 
 
 		 240 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  44.3 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  44.26 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  41.2 
 
 		 237 aa  205  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  42.02 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  0.000044786 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  41.84 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  42.13 
 
 		 254 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  42.13 
 
 		 254 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  42.13 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  42.13 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  40.43 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  41.28 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  40.85 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  40.85 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  39.5 
 
 		 247 aa  198  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  38.75 
 
 		 243 aa  197  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  41.42 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  41.84 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  40.66 
 
 		 242 aa  194  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  39.5 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000275833  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  40.76 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  42.13 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  40.34 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  40.42 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  41.6 
 
 		 252 aa  190  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  41.7 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  38.72 
 
 		 245 aa  187  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  40.43 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  38.98 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  41.63 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  39.32 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  38.59 
 
 		 250 aa  181  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  39.24 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  38.2 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  37.45 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  37.66 
 
 		 245 aa  177  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  37.23 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  37.34 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  37.02 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  37.34 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  39.06 
 
 		 245 aa  174  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  37.72 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  36.36 
 
 		 245 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  36.36 
 
 		 245 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  36.36 
 
 		 245 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  36.8 
 
 		 245 aa  170  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000586023  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  36.36 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  36.4 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  35.93 
 
 		 245 aa  167  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.428207 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  36.36 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  36.36 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  36.36 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  36.36 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  36.36 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  36.36 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  36.36 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  36.36 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  32.48 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  32.54 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  27.31 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  30.73 
 
 		 580 aa  84.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  25.31 
 
 		 574 aa  84  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  27.62 
 
 		 598 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  27.31 
 
 		 574 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  25.61 
 
 		 578 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  28.5 
 
 		 578 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  25.2 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  26.64 
 
 		 577 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  27.45 
 
 		 592 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  25.69 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0829  PHP-like  27.57 
 
 		 580 aa  69.7  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  27.88 
 
 		 578 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000251601  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  28.1 
 
 		 650 aa  68.9  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  24.81 
 
 		 574 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  26.34 
 
 		 594 aa  68.2  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  26.34 
 
 		 578 aa  68.2  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  27.05 
 
 		 614 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  25.85 
 
 		 584 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2126  DNA-directed DNA polymerase  25.29 
 
 		 562 aa  65.5  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  29.33 
 
 		 576 aa  65.1  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  25.81 
 
 		 574 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  25.59 
 
 		 574 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  27.36 
 
 		 570 aa  64.3  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3374  PHP domain protein  25.79 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  26.67 
 
 		 588 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  24.79 
 
 		 543 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  26.12 
 
 		 560 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  23.83 
 
 		 650 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  23.83 
 
 		 642 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  23.36 
 
 		 576 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2341  PHP domain-containing protein  26.63 
 
 		 536 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  26.95 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  28.79 
 
 		 580 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1038  histidinol-phosphatase  25.9 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  25.49 
 
 		 573 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  26.13 
 
 		 570 aa  59.3  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  26.35 
 
 		 584 aa  58.9  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>