19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2032 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_2032  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  100 
 
 
137 aa  267  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000149502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1414  PaREP8 domain-containing protein  51.69 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.199569  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0472  PaREP1 family protein  61.86 
 
 
162 aa  123  7e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.118636  hitchhiker  0.0000000247802 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0697  PaREP1 domain-containing protein  53.66 
 
 
157 aa  121  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0975506  normal  0.271276 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1700  PaREP8 domain-containing protein  58.47 
 
 
163 aa  121  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00498929  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1501  PaREP8 domain-containing protein  53.78 
 
 
162 aa  117  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0237073  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1379  PaREP8 domain-containing protein  33.87 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.611746  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0279  PaREP1 family protein  35 
 
 
185 aa  60.5  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  32.48 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0294  PaREP1 protein  31.45 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0965823  normal  0.0513269 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0049  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  35.29 
 
 
199 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1160  PaREP1 domain-containing protein  31.97 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  hitchhiker  0.00829062 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2188  PaREP1 domain-containing protein  55.32 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.881035  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0114  PaREP1 domain-containing protein  30.25 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0388  PaREP1 protein  30.84 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0430503  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  32.99 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2354  PaREP1 family protein  26.72 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0097  PaREP8 domain-containing protein  30.83 
 
 
155 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  32.77 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>