39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0975 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1418  cell wall anchor domain-containing protein  79.08 
 
 		 863 aa  1413    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.939763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1897  cell wall anchor domain-containing protein  82.68 
 
 		 878 aa  1382    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0975  oligopeptide binding protein, putative  100 
 
 		 867 aa  1767    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.200479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0913  cell wall anchor domain-containing protein  80.42 
 
 		 868 aa  1397    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.694923 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0618  solute binding protein-like protein  30.08 
 
 		 820 aa  362  2e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0800  solute binding protein-like protein  29.49 
 
 		 919 aa  277  8e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0149  solute binding protein-like protein  30.75 
 
 		 895 aa  248  4e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1065  oligopeptide binding protein, putative  30.21 
 
 		 701 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000159871  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2180  solute binding protein-like protein  27.75 
 
 		 862 aa  207  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521964  normal  0.207273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1074  solute binding protein-like protein  27.63 
 
 		 843 aa  207  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.297086  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2228  conserved hypothetical protein  25.53 
 
 		 903 aa  206  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0396  extracellular solute-binding protein family 5  25.37 
 
 		 868 aa  191  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1072  putative lipoprotein  26.35 
 
 		 871 aa  191  7e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000214841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13080  lipoprotein, putative  27.05 
 
 		 612 aa  174  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.05 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0564  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 607 aa  57.4  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000010438  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1168  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 606 aa  54.7  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000870652  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 538 aa  52.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 544 aa  52.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 531 aa  52.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 579 aa  51.2  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 579 aa  50.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 587 aa  50.8  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 580 aa  50.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2455  extracellular solute-binding protein family 5  24.92 
 
 		 543 aa  49.7  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169374 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 578 aa  48.9  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 640 aa  48.9  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 		 551 aa  48.5  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  25.11 
 
 		 527 aa  47  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 		 524 aa  47  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2724  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 		 544 aa  47  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117295  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1273  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  25 
 
 		 531 aa  45.8  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0104885  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3264  extracellular solute-binding protein family 5  31.87 
 
 		 550 aa  45.8  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0794  extracellular solute-binding protein family 5  24.26 
 
 		 1437 aa  45.8  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0894131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  24.71 
 
 		 595 aa  45.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  28.07 
 
 		 524 aa  45.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2491  extracellular solute-binding protein family 5  51.35 
 
 		 593 aa  45.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000117082  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 638 aa  44.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3547  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  25.35 
 
 		 515 aa  44.7  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000727174  normal  0.0236631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>