41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0673 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0673  major facilitator transporter  100 
 
 		 401 aa  766    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.317813 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0200  major facilitator transporter  77.55 
 
 		 405 aa  569  1e-161  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1237  major facilitator transporter  76.79 
 
 		 413 aa  559  1e-158  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0184  major facilitator transporter  72.22 
 
 		 405 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000680371  normal  0.9474 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1385  major facilitator transporter  58.46 
 
 		 405 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0679  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.695505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  26.92 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  25.8 
 
 		 413 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  25.8 
 
 		 413 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  25.8 
 
 		 413 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  25.8 
 
 		 413 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  25.8 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  28.75 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  25.8 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  25 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  25.73 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 426 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 387 aa  50.4  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  28.04 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0075  major facilitator transporter  28 
 
 		 343 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.884221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 424 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  29.33 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.37 
 
 		 569 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1355  major facilitator superfamily MFS_1  43.86 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.358064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 439 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00332  conserved hypothetical protein  26.38 
 
 		 523 aa  43.1  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>