31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1385 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1385  major facilitator transporter  100 
 
 
405 aa  756    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0673  major facilitator transporter  61.46 
 
 
401 aa  392  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.317813 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1237  major facilitator transporter  59.22 
 
 
413 aa  392  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0200  major facilitator transporter  57.89 
 
 
405 aa  390  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0184  major facilitator transporter  61.25 
 
 
405 aa  347  3e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000680371  normal  0.9474 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0679  major facilitator transporter  29.07 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.695505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  25.39 
 
 
397 aa  57  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  27.35 
 
 
419 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  28.41 
 
 
413 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  27.06 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  27.06 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
408 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
413 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
413 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
413 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
413 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
413 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  25.43 
 
 
398 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
430 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  31.71 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  27.56 
 
 
425 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.93 
 
 
387 aa  47.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  26.39 
 
 
418 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  31.12 
 
 
426 aa  47.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  26.3 
 
 
405 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0075  major facilitator transporter  25.53 
 
 
343 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.884221  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 
474 aa  43.9  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>