32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0184 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0184  major facilitator transporter  100 
 
 
405 aa  765    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000680371  normal  0.9474 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1237  major facilitator transporter  81.42 
 
 
413 aa  605  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0200  major facilitator transporter  74.62 
 
 
405 aa  547  1e-154  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0673  major facilitator transporter  72.22 
 
 
401 aa  518  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.317813 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1385  major facilitator transporter  57.86 
 
 
405 aa  346  5e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0679  major facilitator transporter  30.75 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.695505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
424 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.58 
 
 
387 aa  60.1  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  25.53 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  24.64 
 
 
408 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  24.64 
 
 
413 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 
430 aa  53.5  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  24.64 
 
 
413 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  24.64 
 
 
413 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  24.64 
 
 
413 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  24.64 
 
 
413 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  26.51 
 
 
419 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  29.94 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  30.86 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  25.95 
 
 
413 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  26.2 
 
 
419 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  26.2 
 
 
419 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 
429 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  28.32 
 
 
425 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  26.74 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  28.78 
 
 
429 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0075  major facilitator transporter  28.02 
 
 
343 aa  47  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.884221  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  29.29 
 
 
398 aa  45.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36 
 
 
478 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 
421 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>