24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0679 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0679  major facilitator transporter  100 
 
 		 384 aa  732    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.695505 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0200  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 405 aa  86.3  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0673  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.317813 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1237  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  24.93 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1385  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0184  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000680371  normal  0.9474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0482  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 472 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  40.32 
 
 		 510 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  24.43 
 
 		 465 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  37.1 
 
 		 503 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  23.41 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 		 437 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0314  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  28.4 
 
 		 418 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>