More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4048 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_4048  acetyltransferase  100 
 
 
214 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2222  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02592  O-acetyltransferase  38.19 
 
 
192 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2454  hypothetical protein  34.33 
 
 
202 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0406418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1177  hypothetical protein  34.04 
 
 
193 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3056  hexapaptide repeat-containing transferase  32.47 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0674  hypothetical protein  35.84 
 
 
194 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2207  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.29 
 
 
190 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2122  CheW protein  30.87 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0925774  normal  0.486668 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  32.64 
 
 
178 aa  62.8  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0883  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  42.59 
 
 
163 aa  62  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00414991  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0769  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  36.59 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3819  putative acetyltransferase (virginiamycin, streptogramin A, chloramphenicol)  33.61 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0731893  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2976  Tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain protein  30.72 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1814  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2-carboxylate N-succinyltransferase  33.56 
 
 
232 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000825508  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3583  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.45 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  34.11 
 
 
185 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3541  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.83 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2408  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.11 
 
 
186 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0483  maltose O-acetyltransferase  28.87 
 
 
189 aa  58.5  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.833227  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06920  hypothetical protein  27.87 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.832713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4083  hexapaptide repeat-containing transferase  48.33 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636222  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1390  hexapaptide repeat-containing transferase  34.04 
 
 
163 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1952  acetyltransferase  35.71 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582602  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3784  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.2 
 
 
181 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1974  hypothetical protein  35.71 
 
 
187 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.931779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1802  acetyltransferase  33.57 
 
 
188 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  32.89 
 
 
219 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6294  acetyltransferase  32.46 
 
 
191 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148142  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1486  isoleucine patch superfamily acetyltransferase-like protein  31.54 
 
 
278 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1308  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  35.71 
 
 
163 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7377  acetyltransferase, putative  48.15 
 
 
195 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00823618  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1354  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  31.08 
 
 
195 aa  55.5  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  30.7 
 
 
185 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1480  acetyltransferase  46.77 
 
 
187 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05940  Maltose O-acetyltransferase  31.82 
 
 
213 aa  54.7  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0195376  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0142  acetyltransferase  32.14 
 
 
208 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0147  capsular polysaccharide synthesis enzyme O-acetyl transferase Cap5H, putative  32.14 
 
 
208 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2830  acetyltransferase  38.96 
 
 
176 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00579309  normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1249  acetyltransferase  32.99 
 
 
161 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  31.54 
 
 
545 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4847  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.66 
 
 
550 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0521363 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  33 
 
 
175 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4433  putative acetyltransferase (virginiamycin, streptogramin A, chloramphenicol)  26.92 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1079  putative acetyltransferase  30.34 
 
 
177 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.770563  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  29.52 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3508  nodulation protein L  48.15 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0002287  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1750  hexapaptide repeat-containing transferase  34.31 
 
 
182 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410351  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1384  streptogramin A acetyl transferase  36.47 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0253879 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00930  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  31.25 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2366  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.36 
 
 
174 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2683  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  27.45 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000102069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3285  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  30.77 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4905  hexapaptide repeat-containing transferase  31.25 
 
 
174 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1991  antibiotic acetyltransferase  26.8 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4339  hypothetical protein  33.67 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.257588  normal  0.0431137 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0821  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  30.4 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.468594  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0613  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  25.73 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1722  hexapaptide repeat-containing transferase  29.13 
 
 
232 aa  52.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58644  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1900  maltose O-acetyltransferase  28.46 
 
 
197 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1998  chloramphenicol acetyltransferase  25.62 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.427174  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0293  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  34.29 
 
 
257 aa  52.8  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  48.08 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3095  hexapaptide repeat-containing transferase  49.15 
 
 
239 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.165073 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3155  maltose O-acetyltransferase  44.64 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000124616  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3050  maltose O-acetyltransferase  44.64 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000408787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3402  maltose O-acetyltransferase  44.64 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00827475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3747  nodulation protein L  44.44 
 
 
184 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103184  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3377  maltose O-acetyltransferase  44.64 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0686  nodulation protein L  44.44 
 
 
184 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00118691  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5291  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.22 
 
 
550 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.111996 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3556  nodulation protein L  46.15 
 
 
184 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00247017  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3624  nodulation protein L  44.44 
 
 
184 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1874  maltose O-acetyltransferase  47.17 
 
 
187 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1487  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  29.25 
 
 
239 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.187706  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0072  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  28.93 
 
 
209 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1657  hypothetical protein  41.89 
 
 
145 aa  52.4  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  50 
 
 
187 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1458  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  29.25 
 
 
239 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.484512  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 
187 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0668  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  30.86 
 
 
233 aa  52  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1022  Tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain protein  28.76 
 
 
230 aa  52  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3375  maltose O-acetyltransferase  47.17 
 
 
187 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.567242  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1260  maltose O-acetyltransferase  27.62 
 
 
184 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1463  hexapaptide repeat-containing transferase  39.34 
 
 
192 aa  52  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000251809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  34.95 
 
 
219 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3377  maltose O-acetyltransferase  47.17 
 
 
187 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000821648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3140  maltose O-acetyltransferase  45.45 
 
 
187 aa  51.6  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0964249  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3705  hexapaptide repeat-containing transferase  29.51 
 
 
204 aa  51.6  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  34.95 
 
 
219 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04620  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  29.51 
 
 
218 aa  51.6  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3669  transferase hexapeptide repeat containing protein  51.92 
 
 
229 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.252735 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1900  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  32.82 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1146  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.82 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0251  galactoside O-acetyltransferase  36.21 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0630032  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0314  galactoside O-acetyltransferase  28.3 
 
 
197 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.169128  hitchhiker  0.000159689 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1850  maltose O-acetyltransferase  28.83 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3080  hexapaptide repeat-containing transferase  48.08 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00258923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3451  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  34.78 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1762  hexapaptide repeat-containing transferase  26.54 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0373  galactoside O-acetyltransferase  31.78 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>