More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1308 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1308  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  100 
 
 
163 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2073  transferase hexapeptide repeat containing protein  48.51 
 
 
187 aa  97.1  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3758  hypothetical protein  49.12 
 
 
245 aa  96.7  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000689053  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1952  acetyltransferase  46.43 
 
 
191 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582602  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0739  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.85 
 
 
200 aa  89.4  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.597159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2366  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.14 
 
 
174 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  41.82 
 
 
185 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0399  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  34.36 
 
 
192 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.345276  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  43.86 
 
 
185 aa  84.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1611  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.62 
 
 
200 aa  84.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.852212  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5448  hexapaptide repeat-containing transferase  43.36 
 
 
164 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.848437  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  42.98 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2830  acetyltransferase  47.83 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00579309  normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3541  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.06 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5070  hexapaptide repeat-containing transferase  40.54 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.826071  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5216  hexapaptide repeat-containing transferase  41.44 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502922  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6294  acetyltransferase  45.37 
 
 
191 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148142  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0384  Maltose O-acetyltransferase  38.1 
 
 
213 aa  80.5  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00312808  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5163  acetyltransferase  39.64 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3583  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.49 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3508  nodulation protein L  39.29 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0002287  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1396  maltose O-acetyltransferase  39.82 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000138737  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0302  hexapaptide repeat-containing transferase  40.54 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.145068 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11077  sugar O-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03380)  35.26 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2328  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.430878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2963  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.734679  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2942  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4918  hexapaptide repeat-containing transferase  40.71 
 
 
191 aa  79  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2631  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.778978  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02281  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily) protein  41.59 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2577  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3590  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  36.29 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3135  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.4 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2179  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.18 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.167318  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0407  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.26 
 
 
223 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3556  nodulation protein L  41.03 
 
 
184 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00247017  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2373  transferase hexapeptide repeat containing protein  46.46 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06920  hypothetical protein  40.35 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.832713  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1390  hexapaptide repeat-containing transferase  33.96 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3624  nodulation protein L  41.03 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00296  galactoside O-acetyltransferase  36.51 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3264  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.51 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0415  galactoside O-acetyltransferase  36.51 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00300  hypothetical protein  36.51 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.279411  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0314  galactoside O-acetyltransferase  36.84 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.169128  hitchhiker  0.000159689 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5291  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.6 
 
 
550 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.111996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0502  maltose O-acetyltransferase  38.05 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000791  acetyltransferase  38.39 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3283  galactoside O-acetyltransferase  36.51 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142249  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3106  acetyltransferase  32.92 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.440449  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00410  maltose O-acetyltransferase  37.17 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3151  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.17 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00415  hypothetical protein  37.17 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000385  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  36.96 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0767  nodulation protein L  33.93 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.55437  hitchhiker  0.000000843349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3034  putative sugar acetyltransferase  44.68 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0535  maltose O-acetyltransferase  37.17 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3747  nodulation protein L  40.91 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103184  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0355  transferase hexapeptide protein  37.58 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3157  maltose O-acetyltransferase  37.17 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0494  maltose O-acetyltransferase  37.17 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  51.22 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06688  acetyltransferase  39.29 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.31 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0939  maltose O-acetyltransferase  37.39 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0954  maltose O-acetyltransferase  36.17 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.186778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0373  galactoside O-acetyltransferase  36.51 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1531  hexapaptide repeat-containing transferase  42.39 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000154529  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0513  maltose O-acetyltransferase  40 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000528215  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  36.42 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0465  maltose O-acetyltransferase  44.44 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0760174  hitchhiker  0.0000000000353002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0532  maltose O-acetyltransferase  40 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0502164  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0686  nodulation protein L  40.17 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00118691  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1576  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0096  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.87 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000143526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0391  maltose O-acetyltransferase  37.17 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4774  maltose O-acetyltransferase  44.44 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.789771  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05940  Maltose O-acetyltransferase  48.24 
 
 
213 aa  73.9  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0195376  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.5 
 
 
190 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1850  maltose O-acetyltransferase  39.81 
 
 
215 aa  73.9  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4492  hexapaptide repeat-containing transferase  44.19 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2125  putative sugar acetyltransferase  38.38 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2439  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  31.52 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1463  hexapaptide repeat-containing transferase  36.55 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000251809  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1900  maltose O-acetyltransferase  39.82 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0997  galactoside O-acetyltransferase  40.17 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.158856  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00930  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  42.86 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2637  hexapaptide repeat-containing transferase  64.91 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.94707 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0418  acetyltransferase  38.21 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.576199  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4339  hypothetical protein  42.97 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.257588  normal  0.0431137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3624  hexapaptide repeat-containing transferase  47.5 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  34.31 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  44.83 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1584  hexapaptide repeat-containing transferase  41.53 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0522  maltose O-acetyltransferase  38.89 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00115683  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0575  maltose O-acetyltransferase  38.89 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00855967  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.31 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3080  hexapaptide repeat-containing transferase  39.56 
 
 
187 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00258923  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  35.86 
 
 
194 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560945  normal  0.127404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>