More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3705 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3705  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4229  hexapaptide repeat-containing transferase  56.65 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4432  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  52.71 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4118  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  51.23 
 
 		 205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4433  putative acetyltransferase (virginiamycin, streptogramin A, chloramphenicol)  54.5 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0769  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  50.99 
 
 		 225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3819  putative acetyltransferase (virginiamycin, streptogramin A, chloramphenicol)  49.5 
 
 		 258 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0731893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4083  hexapaptide repeat-containing transferase  49.5 
 
 		 221 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636222  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0821  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  49.75 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.468594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2190  putative acetyltransferase protein  52.94 
 
 		 218 aa  197  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.216919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0138  transferase hexapeptide protein  48.02 
 
 		 215 aa  194  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0182883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2921  hexapeptide repeat-containing phosphonate metabolisn transferase  50.74 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0277  acetyltransferase  53.3 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.79326  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5859  putative acetyltransferase  49.01 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1415  antibiotic acetyltransferase  44.78 
 
 		 229 aa  177  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.241418  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1753  putative acetyltransferase  46.53 
 
 		 209 aa  174  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1762  hexapaptide repeat-containing transferase  40.8 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0933  hexapeptide repeat-containing transferase  38.61 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.201434  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0072  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  43.39 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1991  antibiotic acetyltransferase  37.31 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0513  putative acetyltransferase (virginiamycin, streptogramin A, chloramphenicol)  42.93 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3571  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  44.1 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.414497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3451  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  44.57 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1384  streptogramin A acetyl transferase  37.7 
 
 		 226 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0253879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4944  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  38.89 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0913  chloramphenicol acetyltransferase  35.77 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2756  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  35.93 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.801902  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1763  streptogramin A acetyl transferase  39.6 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3169  streptogramin A acetyl transferase  37.16 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.210498  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2073  VatB  35.98 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0183643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1978  hexapaptide repeat-containing transferase  39.77 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.811569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0147  capsular polysaccharide synthesis enzyme O-acetyl transferase Cap5H, putative  33.14 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0142  acetyltransferase  33.14 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2049  VatB  35.37 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2593  streptogramin A acetyl transferase  42.86 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1569  hexapaptide repeat-containing transferase  42.86 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0704  chloramphenicol O-acetyltransferase  36.09 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.191265  normal  0.790707 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1600  hexapaptide repeat-containing transferase  42.86 
 
 		 218 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000573546  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2692  streptogramin A acetyl transferase  42.86 
 
 		 224 aa  101  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2526  streptogramin A acetyl transferase  42.06 
 
 		 167 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1155  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.44 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0378081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0332  putative acetyltransferase  41.35 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0346  putative acetyltransferase  41.35 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1706  putative acetyltransferase  41.35 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558833  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1461  hexapaptide repeat-containing transferase  42.06 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1563  hexapaptide repeat-containing transferase  40.94 
 
 		 218 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2780  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.27 
 
 		 218 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737809  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0600  hexapaptide repeat-containing transferase  36.94 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.152008  normal  0.590208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3901  hexapaptide repeat-containing transferase  41.67 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2866  streptogramin A acetyl transferase  40.94 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.72072  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0223  hexapaptide repeat-containing transferase  34.76 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1121  acetyl transferase  34.24 
 
 		 268 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1575  hexapaptide repeat-containing transferase  36.23 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2783  hexapaptide repeat-containing transferase  34.24 
 
 		 268 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.290398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3259  putative acetyltransferase  33.33 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1998  chloramphenicol acetyltransferase  32.28 
 
 		 213 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.427174  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2950  chloramphenicol O-acetyltransferase  35.21 
 
 		 210 aa  94.4  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359614  normal  0.149612 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  36.84 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  33.96 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.476323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  36.84 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1388  hexapaptide repeat-containing transferase  36.62 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220754  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4299  chloramphenicol acetyltransferase  38.46 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4504  streptogramin A acetyl transferase  41.73 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3248  chloramphenicol acetyltransferase  35 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882178  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0391  streptogramin A acetyl transferase  34.78 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1258  transferase  38.67 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0994  acetyltransferase  39.26 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2536  hypothetical protein  40.94 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  34.91 
 
 		 219 aa  91.7  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5557  hexapaptide repeat-containing transferase  34.87 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4048  acetyltransferase  36.42 
 
 		 209 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.638 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2647  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  40.16 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000095527 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2303  hexapaptide repeat-containing transferase  36.18 
 
 		 219 aa  90.5  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  33.71 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0420  putative acetyltransferase  38.71 
 
 		 241 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.857208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  33.14 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2450  acetyltransferase  40.16 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.602654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2629  acetyltransferase  40.16 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14160  putative acetyltransferase  38.67 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3339  acetyltransferase  31.43 
 
 		 185 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00224861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3600  acetyltransferase  31.43 
 
 		 185 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000293004  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0155  hexapaptide repeat-containing transferase  39.68 
 
 		 212 aa  89.4  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479916 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  33.14 
 
 		 185 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1181  antibiotic acetyltransferase  35.66 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0246811  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3304  acetyltransferase  31.43 
 
 		 185 aa  89  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  31.43 
 
 		 185 aa  89  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5872  streptogramin A acetyl transferase  34.78 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1334  putative acetyltransferase  32.35 
 
 		 257 aa  88.6  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.06 
 
 		 187 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  39.06 
 
 		 187 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1494  chloramphenicol O-acetyltransferase  37.5 
 
 		 218 aa  88.2  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00845499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04620  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  38.61 
 
 		 218 aa  88.2  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2320  chloramphenicol O-acetyltransferase  37.01 
 
 		 213 aa  88.2  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1883  hypothetical protein  37.3 
 
 		 213 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2511  virginiamycin A acetyltransferase  34.76 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.153817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2656  acetyltransferase  34.87 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2698  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  38.58 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.832761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  34.87 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  31.61 
 
 		 185 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1536  putative chloramphenicol acetyltransferase  34.51 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000290239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>