298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3322 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02393  polyphosphate kinase  53.85 
 
 		 688 aa  768    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.16089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1168  Polyphosphate kinase  53.85 
 
 		 688 aa  768    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1333  polyphosphate kinase  53.48 
 
 		 690 aa  734    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.827209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2945  polyphosphate kinase  53.62 
 
 		 690 aa  736    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1175  polyphosphate kinase  53.85 
 
 		 688 aa  768    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.739142  normal  0.0387468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1870  polyphosphate kinase  53.3 
 
 		 723 aa  772    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3724  polyphosphate kinase  53.85 
 
 		 688 aa  768    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2990  polyphosphate kinase  53.85 
 
 		 686 aa  767    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.555438 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2784  polyphosphate kinase  53.85 
 
 		 688 aa  768    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004381  polyphosphate kinase  54.34 
 
 		 696 aa  788    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1344  polyphosphate kinase  55.6 
 
 		 687 aa  760    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2649  polyphosphate kinase  53.85 
 
 		 688 aa  768    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03153  polyphosphate kinase  69.21 
 
 		 690 aa  986    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1236  polyphosphate kinase  53.04 
 
 		 689 aa  739    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.431819  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2875  polyphosphate kinase  53.85 
 
 		 688 aa  767    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3541  polyphosphate kinase  55.6 
 
 		 687 aa  764    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0257  polyphosphate kinase  55.38 
 
 		 701 aa  786    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02355  hypothetical protein  53.85 
 
 		 688 aa  768    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2697  polyphosphate kinase  53.55 
 
 		 688 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1821  polyphosphate kinase  53.3 
 
 		 723 aa  772    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.245967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2870  polyphosphate kinase  53.55 
 
 		 688 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2636  polyphosphate kinase  53.85 
 
 		 688 aa  768    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.513516  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3322  polyphosphate kinase  100 
 
 		 694 aa  1425    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936103  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2739  polyphosphate kinase  53.55 
 
 		 688 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1834  polyphosphate kinase  53.3 
 
 		 723 aa  773    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2207  polyphosphate kinase  54.04 
 
 		 720 aa  780    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2284  polyphosphate kinase  54.19 
 
 		 720 aa  784    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1227  polyphosphate kinase  55.6 
 
 		 687 aa  760    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1733  polyphosphate kinase  53.12 
 
 		 720 aa  774    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2649  polyphosphate kinase  53.55 
 
 		 688 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.751594  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2455  Polyphosphate kinase  53.3 
 
 		 723 aa  772    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.483132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2417  polyphosphate kinase  54.04 
 
 		 720 aa  782    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3113  polyphosphate kinase  55.6 
 
 		 687 aa  760    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3079  polyphosphate kinase  55.04 
 
 		 724 aa  790    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2672  polyphosphate kinase  54.06 
 
 		 689 aa  738    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2011  polyphosphate kinase  54.57 
 
 		 730 aa  781    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.904414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2414  polyphosphate kinase  54.01 
 
 		 722 aa  768    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.259226  hitchhiker  0.0000368417 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2761  polyphosphate kinase  53.55 
 
 		 688 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01030  polyphosphate kinase  53.75 
 
 		 709 aa  776    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0074  polyphosphate kinase  46.65 
 
 		 695 aa  623  1e-177  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2038  Polyphosphate kinase  43.83 
 
 		 701 aa  599  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11913  polyphosphate kinase  42.75 
 
 		 700 aa  563  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.599614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4535  polyphosphate kinase  42.9 
 
 		 692 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1636  Polyphosphate kinase  41.04 
 
 		 684 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591641  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3685  Polyphosphate kinase  37 
 
 		 718 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10963  polyphosphate kinase  39.36 
 
 		 690 aa  482  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246425  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2540  Polyphosphate kinase  37.85 
 
 		 679 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2663  polyphosphate kinase  35.7 
 
 		 712 aa  433  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.100975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  37.64 
 
 		 715 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2480  Polyphosphate kinase  37.26 
 
 		 659 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.480746 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  36.09 
 
 		 720 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  36.14 
 
 		 695 aa  428  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  35.6 
 
 		 736 aa  425  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2292  polyphosphate kinase  36.43 
 
 		 713 aa  425  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  36.2 
 
 		 720 aa  422  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  35.44 
 
 		 715 aa  423  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  35.47 
 
 		 702 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1885  polyphosphate kinase  35.57 
 
 		 695 aa  421  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1414  Polyphosphate kinase  36.08 
 
 		 687 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  35.45 
 
 		 700 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1454  polyphosphate kinase  34.85 
 
 		 700 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.642345  normal  0.0713847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  35.37 
 
 		 702 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1977  Polyphosphate kinase  35.17 
 
 		 714 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142545  normal  0.39772 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  35.02 
 
 		 720 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  34.62 
 
 		 721 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3851  polyphosphate kinase  35.34 
 
 		 673 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  35.37 
 
 		 700 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  35.37 
 
 		 702 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  35.37 
 
 		 702 aa  411  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  35.37 
 
 		 702 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  36.97 
 
 		 727 aa  412  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  34.96 
 
 		 722 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  35.37 
 
 		 702 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  35.23 
 
 		 702 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  34.4 
 
 		 743 aa  410  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  35.37 
 
 		 702 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  34.96 
 
 		 722 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  35.41 
 
 		 708 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  35.39 
 
 		 681 aa  405  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  36.61 
 
 		 721 aa  405  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  33.59 
 
 		 726 aa  403  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  34.26 
 
 		 731 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3822  polyphosphate kinase  34.79 
 
 		 702 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21771  polyphosphate kinase  36.3 
 
 		 709 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.487235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  33.43 
 
 		 710 aa  399  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1304  polyphosphate kinase  36.15 
 
 		 709 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2534  polyphosphate kinase  36.17 
 
 		 727 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0233  polyphosphate kinase  35.57 
 
 		 764 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.61377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1250  polyphosphate kinase  36.02 
 
 		 724 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749119 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2047  polyphosphate kinase  34.74 
 
 		 721 aa  395  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3719  Polyphosphate kinase  34.55 
 
 		 823 aa  392  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  34.65 
 
 		 731 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2466  polyphosphate kinase  34.07 
 
 		 693 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  32.62 
 
 		 701 aa  394  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  34.19 
 
 		 728 aa  395  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2935  polyphosphate kinase  33.33 
 
 		 702 aa  395  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  35.07 
 
 		 705 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  33.99 
 
 		 694 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2824  polyphosphate kinase  34.4 
 
 		 693 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29941  polyphosphate kinase  34.02 
 
 		 712 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.500566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>