21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2388 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2388  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01915  hypothetical protein  33.66 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.429249  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3596  type IV pilus assembly PilZ  31.58 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0292  hypothetical protein  25.96 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000146713  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3949  type IV pilus assembly PilZ  27.68 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4246  hypothetical protein  27.27 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2668  type IV pilus assembly PilZ  24.77 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0672  hypothetical protein  24.87 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3582  hypothetical protein  26.96 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2266  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.116308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0992  hypothetical protein  26.55 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0848  hypothetical protein  26.55 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.10808  normal  0.09437 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0573  type IV pilus assembly PilZ  24.74 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0260  hypothetical protein  25.23 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2953  type IV pilus assembly PilZ  21.24 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2940  hypothetical protein  23.96 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001233  hypothetical protein  20.98 
 
 		 268 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05354  hypothetical protein  27.47 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05100  hypothetical protein  21.95 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1127  type IV pilus assembly PilZ  24.21 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  24.52 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>