31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1748 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1748  50S ribosomal protein L21e  100 
 
 		 100 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00441406  hitchhiker  0.00234817 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1729  50S ribosomal protein L21e  90.91 
 
 		 99 aa  183  8e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.74633 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0578  50S ribosomal protein L21e  89 
 
 		 100 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00254948 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1568  50S ribosomal protein L21e  85 
 
 		 100 aa  179  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0355  50S ribosomal protein L21e  65.26 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1954  ribosomal protein L21e  61.62 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1808  Ribosomal protein L21e  58.16 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0061  50S ribosomal protein L21e  50.51 
 
 		 99 aa  105  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.257868  normal  0.16503 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0905  50S ribosomal protein L21e  39.56 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000341646  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0993  50S ribosomal protein L21e  40 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3231  50S ribosomal protein L21e  37.36 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000418064  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1384  50S ribosomal protein L21e  40.43 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1092  50S ribosomal protein L21e  37.63 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.343816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0854  50S ribosomal protein L21e  37.63 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0214236  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1583  50S ribosomal protein L21e  36.56 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.857138  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1105  50S ribosomal protein L21e  38.71 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3026  50S ribosomal protein L21e  39.13 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1961  50S ribosomal protein L21e  39.33 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.613539  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1874  50S ribosomal protein L21e  37.08 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0547  50S ribosomal protein L21e  38.2 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.017602  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0765  Ribosomal protein L21e  38.71 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1568  50S ribosomal protein L21e  32.95 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0148926 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0057  50S ribosomal protein L21e  32.26 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.280466  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2674  Ribosomal protein L21e  39.76 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.395884 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1098  Ribosomal protein L21e  36.26 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232936  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2388  Ribosomal protein L21e  33.33 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2277  50S ribosomal protein L21e  32.26 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.644218  normal  0.149575 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0624  50S ribosomal protein L21e  34.44 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535137  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46735  predicted protein  36.07 
 
 		 163 aa  43.5  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27810  Ribosomal protein L21, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.25 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.186953 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02170  60s ribosomal protein l21-a, putative  33.33 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.771683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>