39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0262 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  332  1e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1247  hypothetical protein  73.89 
 
 
280 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0202  hypothetical protein  72.79 
 
 
148 aa  233  9e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.377105  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  74.15 
 
 
174 aa  214  5e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  41.12 
 
 
219 aa  72  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.880222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  39.22 
 
 
206 aa  70.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0975  hypothetical protein  40.95 
 
 
220 aa  70.5  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.753876 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1971  hypothetical protein  39.09 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  40.37 
 
 
236 aa  67.4  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  35.34 
 
 
207 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  33.87 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  30.26 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  33.06 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  32.41 
 
 
224 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  31.73 
 
 
219 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  33 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0051  methyltransferase type 12  36.07 
 
 
265 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.139499  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0365  putative RNA methylase  33.61 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0782  hypothetical protein  56.25 
 
 
155 aa  54.7  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138786  normal  0.0233104 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92891  predicted protein  33.65 
 
 
186 aa  54.3  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.399442  normal  0.0255193 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0032  methyltransferase type 12  35.25 
 
 
265 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  32 
 
 
211 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  36 
 
 
210 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1705  putative RNA methylase  31.78 
 
 
155 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  36.36 
 
 
247 aa  52  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1002  methyltransferase type 12  36.89 
 
 
257 aa  50.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  26.21 
 
 
253 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0266  hypothetical protein  31.71 
 
 
249 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0053  methyltransferase type 12  37.74 
 
 
273 aa  48.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  34.95 
 
 
212 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  37.25 
 
 
247 aa  47.8  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0202  methyltransferase type 12  35.92 
 
 
262 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  30.14 
 
 
186 aa  44.3  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35472  predicted protein  25.71 
 
 
228 aa  42.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176314  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37393  predicted protein  25.71 
 
 
228 aa  42.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.392699  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  34.29 
 
 
251 aa  42  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1852  ribosomal L11 methyltransferase  45.83 
 
 
282 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.524439  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.34 
 
 
294 aa  40.8  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  30.53 
 
 
268 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>