35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0200 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0200  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  774    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0673  major facilitator transporter  77.55 
 
 		 401 aa  553  1e-156  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.317813 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1237  major facilitator transporter  72.77 
 
 		 413 aa  539  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0184  major facilitator transporter  74.62 
 
 		 405 aa  472  1e-132  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000680371  normal  0.9474 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1385  major facilitator transporter  57.89 
 
 		 405 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0632886  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0679  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.695505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  26.36 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  27.57 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0075  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.884221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 429 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 418 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  24.48 
 
 		 449 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.4 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1046  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 392 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 410 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 429 aa  42.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>