More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03225 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03225  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein, putative  100 
 
 
774 aa  1548    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4024  protein of unknown function DUF195  74.46 
 
 
518 aa  707    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1755  hypothetical protein  74.11 
 
 
456 aa  580  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1823  competence-induced protein  73.86 
 
 
456 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1104  hypothetical protein  55.07 
 
 
491 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0625  hypothetical protein  55.07 
 
 
491 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0984  hypothetical protein  54.67 
 
 
495 aa  445  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0980  hypothetical protein  54.44 
 
 
495 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1063  hypothetical protein  54.84 
 
 
491 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00852536  normal  0.199867 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0514  RmuC domain-containing protein  55.35 
 
 
491 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2808  putative DNA recombination protein rmuC  55.35 
 
 
491 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.209602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2924  RmuC domain-containing protein  55.35 
 
 
491 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0269427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4217  hypothetical protein  55.07 
 
 
492 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342659  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2869  putative DNA recombination protein RmuC  55.35 
 
 
491 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1820  RmuC domain-containing protein  55.35 
 
 
491 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18092  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2497  RmuC domain-containing protein  55.35 
 
 
491 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0129399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2785  RmuC domain-containing protein  55.35 
 
 
491 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1701  RmuC domain-containing protein  55.35 
 
 
491 aa  438  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0384449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2280  hypothetical protein  54.32 
 
 
488 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0812  hypothetical protein  53.71 
 
 
494 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.465161  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2199  hypothetical protein  54.98 
 
 
492 aa  432  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.134228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1056  hypothetical protein  52.88 
 
 
481 aa  429  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244381  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2928  protein of unknown function DUF195  55.07 
 
 
482 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22926  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2445  hypothetical protein  58.86 
 
 
448 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0965  protein of unknown function DUF195  52.93 
 
 
490 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252696  normal  0.10858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1035  hypothetical protein  52.22 
 
 
457 aa  415  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.371122  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3231  protein of unknown function DUF195  54.69 
 
 
449 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000252546  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2166  hypothetical protein  59.65 
 
 
466 aa  405  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171242  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0900  protein of unknown function DUF195  50.44 
 
 
490 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0908545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0014  hypothetical protein  56.73 
 
 
450 aa  386  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000106215  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0339  hypothetical protein  55.28 
 
 
426 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.709733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1600  hypothetical protein  56.89 
 
 
444 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0970446  normal  0.868802 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1623  hypothetical protein  58.31 
 
 
441 aa  379  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.929748  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1067  protein of unknown function DUF195  52.25 
 
 
508 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3077  hypothetical protein  55.94 
 
 
445 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.194725  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4032  protein of unknown function DUF195  58.06 
 
 
427 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4064  protein of unknown function DUF195  57.5 
 
 
426 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2052  protein of unknown function DUF195  54.37 
 
 
440 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3924  hypothetical protein  57.3 
 
 
426 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.031457  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0015  protein of unknown function DUF195  57.01 
 
 
465 aa  375  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2053  hypothetical protein  58.61 
 
 
479 aa  372  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000533469 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0817  protein of unknown function DUF195  56.64 
 
 
433 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.028407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1775  protein of unknown function DUF195  54.07 
 
 
455 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0011  hypothetical protein  42.25 
 
 
514 aa  368  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1371  protein of unknown function DUF195  54.41 
 
 
566 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2489  hypothetical protein  54.1 
 
 
566 aa  365  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262893  normal  0.047017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3304  hypothetical protein  50.88 
 
 
474 aa  361  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215892  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2070  hypothetical protein  57.45 
 
 
621 aa  358  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0340  protein of unknown function DUF195  54.08 
 
 
438 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0320  protein of unknown function DUF195  54.38 
 
 
440 aa  357  6.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4737  hypothetical protein  51.18 
 
 
509 aa  356  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.543565 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0517  protein of unknown function DUF195  46.65 
 
 
412 aa  355  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0973861  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1514  hypothetical protein  51.73 
 
 
495 aa  346  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174369 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1541  protein of unknown function DUF195  47.03 
 
 
450 aa  330  7e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.756078  hitchhiker  0.00318152 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0189  protein of unknown function DUF195  50.89 
 
 
445 aa  325  2e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0930  protein of unknown function DUF195  48.4 
 
 
450 aa  316  9e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0434  protein of unknown function DUF195  45.6 
 
 
449 aa  311  2.9999999999999997e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00288776  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1767  hypothetical protein  45.35 
 
 
424 aa  300  6e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.258411  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2719  zinc-binding alcohol dehydrogenase  71.78 
 
 
335 aa  297  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4026  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  73.1 
 
 
335 aa  295  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.622195  normal  0.204275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2953  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  71.29 
 
 
335 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1774  hypothetical protein  45.62 
 
 
424 aa  293  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3071  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  69.31 
 
 
335 aa  290  9e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0694028  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5645  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  69.8 
 
 
336 aa  290  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3712  alcohol dehydrogenase  70.59 
 
 
338 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2576  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  66.34 
 
 
335 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  0.646954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18160  putative oxidoreductase  68.97 
 
 
337 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0658  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  66.17 
 
 
337 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1240  putative oxidoreductase  67.15 
 
 
369 aa  273  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522043  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1279  hypothetical protein  43.73 
 
 
451 aa  272  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1577  putative oxidoreductase  68.47 
 
 
337 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2194  hypothetical protein  37.16 
 
 
432 aa  271  4e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3020  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  63.55 
 
 
339 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  65.02 
 
 
349 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.094248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0666  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  66.01 
 
 
337 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2758  zinc-binding alcohol dehydrogenase  65.2 
 
 
337 aa  260  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5176  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.47 
 
 
335 aa  260  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586528  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  61.27 
 
 
337 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5533  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  63 
 
 
336 aa  257  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.328784 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0407  NADPH:quinone reductase  60.78 
 
 
340 aa  257  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3618  NADPH:quinone reductase  60.78 
 
 
340 aa  257  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0406  alcohol dehydrogenase  60.78 
 
 
340 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00507024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3436  alcohol dehydrogenase  60.29 
 
 
340 aa  254  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0074  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  62.07 
 
 
337 aa  253  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1160  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  64.04 
 
 
411 aa  250  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.678703  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0066  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.58 
 
 
337 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3880  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.29 
 
 
340 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3932  alcohol dehydrogenase  59.8 
 
 
340 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3957  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.82 
 
 
340 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4073  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.82 
 
 
340 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2685  putative bifunctional oxidoreductase/alginate lyase  60.59 
 
 
337 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5040  putative oxidoreductase  56.86 
 
 
338 aa  244  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3542  alcohol dehydrogenase  57.84 
 
 
334 aa  241  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.516815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3419  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  58.21 
 
 
337 aa  239  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3158  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  58.33 
 
 
338 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2256  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.11 
 
 
339 aa  234  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.603344  normal  0.181238 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2322  alcohol dehydrogenase  58.33 
 
 
337 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0672997  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3639  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  58.21 
 
 
338 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103532  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1096  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  54.19 
 
 
337 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.381696  normal  0.273466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1753  NADPH:quinone reductase  56 
 
 
333 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>