27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4603 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4603  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 421 aa  874    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218061  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0328  Phage integrase  26.07 
 
 		 394 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.915662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1697  integrase family protein  26.52 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0515  integrase family protein  26.65 
 
 		 428 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2951  integrase family protein  25.13 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.165288  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2902  phage integrase family protein  25.58 
 
 		 400 aa  113  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4063  integrase family protein  25.84 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1126  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1598  integrase family protein  23.21 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527181  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0088  Phage integrase  24.69 
 
 		 427 aa  89.7  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4011  phage integrase family protein  23.51 
 
 		 433 aa  87.4  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.189192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0557  phage integrase family protein  25.66 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.584699  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0582  integrase family protein  25.66 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.790715  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0588  integrase family protein  25.66 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2289  integrase family protein  29.49 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0317  phage integrase  26.37 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4987  Phage integrase  25.34 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2175  phage integrase family protein  23.34 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3234  integrase family protein  28.51 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1369  phage integrase  22.3 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0311  integrase family protein  25.21 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5184  integrase family protein  29.2 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2310  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02971  integrase  29.52 
 
 		 186 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1847  hypothetical protein  25.08 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145425  normal  0.0634735 
 
 
-
 
NC_003296  RS01693  hypothetical protein  25.08 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  22.12 
 
 		 392 aa  43.5  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>