28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3544 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3318  hypothetical protein  96.33 
 
 		 405 aa  766    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0146561  normal  0.285956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2292  hypothetical protein  87.86 
 
 		 404 aa  704    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128179  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3544  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  784    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02460  hypothetical protein  77.17 
 
 		 405 aa  636    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384226  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17680  hypothetical protein  71.16 
 
 		 404 aa  592  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04863  hypothetical protein  57.6 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0063  hypothetical protein  50.79 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.833866  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0052  hypothetical protein  49.74 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0056  hypothetical protein  49.6 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0036  hypothetical protein  50 
 
 		 402 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0420  hypothetical protein  49.86 
 
 		 402 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0126  hypothetical protein  45.97 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2111  hypothetical protein  45.69 
 
 		 423 aa  345  6e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000232202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1621  hypothetical protein  34.76 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2228  hypothetical protein  25.31 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5750  hypothetical protein  23.71 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3170  hypothetical protein  25.6 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0532  hypothetical protein  23.3 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.617101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0967  hypothetical protein  25.15 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0252662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1603  hypothetical protein  22.36 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2640  hypothetical protein  22.3 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3965  hypothetical protein  24.37 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00271264  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2941  hypothetical protein  21.65 
 
 		 276 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0076  hypothetical protein  29.79 
 
 		 109 aa  49.7  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0102  Aldose 1-epimerase  22.01 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3241  hypothetical protein  22.92 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2888  hypothetical protein  19.6 
 
 		 279 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3717  hypothetical protein  25.4 
 
 		 323 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  0.31665 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>