32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3386 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  100 
 
 		 784 aa  1588    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  26.58 
 
 		 749 aa  124  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  26.12 
 
 		 706 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  23.75 
 
 		 728 aa  115  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  26.3 
 
 		 715 aa  104  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  25.25 
 
 		 862 aa  99  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  29.66 
 
 		 884 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  23.19 
 
 		 758 aa  94  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  21.48 
 
 		 736 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  29.96 
 
 		 315 aa  91.3  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  24.29 
 
 		 706 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  24.56 
 
 		 735 aa  79.7  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5211  KAP P-loop domain-containing protein  29.79 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  22.26 
 
 		 672 aa  68.9  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0561  hypothetical protein  28.42 
 
 		 577 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  23.25 
 
 		 615 aa  57.4  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  24.09 
 
 		 622 aa  54.7  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  21.85 
 
 		 623 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  22.5 
 
 		 671 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  18.5 
 
 		 945 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  21.77 
 
 		 594 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  25.19 
 
 		 644 aa  48.5  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  25 
 
 		 471 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  23.67 
 
 		 394 aa  47.8  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  21.22 
 
 		 628 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  21.22 
 
 		 628 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  21.22 
 
 		 628 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  21.74 
 
 		 571 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  23.62 
 
 		 580 aa  46.2  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  24.81 
 
 		 650 aa  45.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  23.77 
 
 		 647 aa  44.3  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  24.46 
 
 		 591 aa  44.3  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>