18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2009 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2009  hypothetical protein  100 
 
 		 539 aa  1088    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.401812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3409  hypothetical protein  35.4 
 
 		 609 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2007  hypothetical protein  34.52 
 
 		 618 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1488  hypothetical protein  25.65 
 
 		 488 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2013  hypothetical protein  29.61 
 
 		 220 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2035  hypothetical protein  25.71 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.045706  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1879  hypothetical protein  25.09 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.363946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3828  hypothetical protein  22.82 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2898  hypothetical protein  22.97 
 
 		 665 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319126  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1462  hypothetical protein  23 
 
 		 592 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0152709  normal  0.836043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3410  hypothetical protein  23.18 
 
 		 877 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00835296  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0355  hypothetical protein  27.22 
 
 		 239 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2226  hypothetical protein  25.09 
 
 		 515 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148711  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3826  hypothetical protein  25.28 
 
 		 485 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0241  hypothetical protein  27.22 
 
 		 254 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2033  hypothetical protein  23.54 
 
 		 692 aa  47  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.68531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2012  hypothetical protein  26.67 
 
 		 178 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5183  hypothetical protein  32.63 
 
 		 239 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.836807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>