197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1143 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1143  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284928  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0983  hypothetical protein  96.17 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.015485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4716  hypothetical protein  76.33 
 
 		 207 aa  314  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0786  hypothetical protein  72.95 
 
 		 206 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0800  hypothetical protein  71.63 
 
 		 206 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0758  hypothetical protein  72.46 
 
 		 206 aa  305  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4430  hypothetical protein  71.01 
 
 		 206 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3670  hypothetical protein  71.01 
 
 		 205 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41280  hypothetical protein  67.15 
 
 		 205 aa  272  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5280  hypothetical protein  68.6 
 
 		 204 aa  271  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.191722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61320  hypothetical protein  67.15 
 
 		 204 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.681363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  36.94 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  36.77 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  36 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  36.68 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  36.36 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  35.4 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  34.38 
 
 		 222 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  31.11 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  36.8 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  32.1 
 
 		 253 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  36.67 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  34.38 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  32.26 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  32.49 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  36.09 
 
 		 243 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  33.03 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  32.3 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  29.15 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  36 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  29.57 
 
 		 231 aa  98.6  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  32.51 
 
 		 261 aa  98.6  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  35.34 
 
 		 253 aa  98.2  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  32.79 
 
 		 253 aa  98.2  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  32.14 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  33.88 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  31.13 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  27.6 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  32.58 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  34.48 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  28.95 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3022  hypothetical protein  36.98 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.310509  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  31.8 
 
 		 233 aa  95.1  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  27.71 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  32.39 
 
 		 257 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  32.88 
 
 		 239 aa  95.1  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  30.26 
 
 		 259 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  30.67 
 
 		 224 aa  94.7  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  32 
 
 		 227 aa  94.7  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  94.7  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  31.3 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  32.9 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  32.9 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  32.23 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  32.6 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  26.67 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  34.78 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  30.22 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  33.91 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  34.56 
 
 		 254 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  31.3 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  27.71 
 
 		 242 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  32.16 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  31.11 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  33.04 
 
 		 257 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  33.18 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  32.82 
 
 		 261 aa  90.1  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  27.6 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  31.98 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  32.11 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  31.28 
 
 		 259 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  38.13 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  26.41 
 
 		 239 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  31.71 
 
 		 252 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  29.33 
 
 		 225 aa  89  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  32.42 
 
 		 241 aa  89  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  30.08 
 
 		 254 aa  88.6  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  31.65 
 
 		 255 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  29.65 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  31.47 
 
 		 252 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  34.9 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  33.49 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  29.52 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  31.2 
 
 		 234 aa  86.7  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  29.89 
 
 		 259 aa  85.9  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  28.39 
 
 		 254 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  27.49 
 
 		 255 aa  85.9  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  30.22 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  29.89 
 
 		 290 aa  85.5  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  30.46 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  29.11 
 
 		 268 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  29.33 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  31.56 
 
 		 252 aa  85.1  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  28.69 
 
 		 261 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  35.33 
 
 		 191 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  29.8 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  28.45 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  40.18 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  29.36 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>