90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4995 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  69.5 
 
 		 604 aa  816    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0933  LppC family lipoprotein  66.49 
 
 		 605 aa  736    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13140  LppC lipoprotein  68.37 
 
 		 607 aa  812    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  72.5 
 
 		 602 aa  842    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4523  LppC family lipoprotein  67.19 
 
 		 605 aa  753    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4684  LppC putative lipoprotein  66 
 
 		 603 aa  777    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  69.67 
 
 		 604 aa  817    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  100 
 
 		 604 aa  1197    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  97.35 
 
 		 604 aa  1169    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1325  LppC family lipoprotein  67.19 
 
 		 605 aa  751    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.967741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4399  LppC family lipoprotein  67.24 
 
 		 605 aa  752    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3145  ATPase  37.29 
 
 		 661 aa  363  6e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  39.96 
 
 		 629 aa  352  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2200  LppC putative lipoprotein  36.48 
 
 		 596 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2463  LppC family lipoprotein  37.13 
 
 		 617 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  34.83 
 
 		 603 aa  287  4e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  34.64 
 
 		 603 aa  284  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  36.15 
 
 		 635 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  37.66 
 
 		 628 aa  256  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  32.48 
 
 		 631 aa  249  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1933  putative lipoprotein  38.24 
 
 		 394 aa  249  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.814696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0260  lipoprotein antigen  38.24 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  32.71 
 
 		 625 aa  229  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4336  LppC family lipoprotein  31.01 
 
 		 674 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765962  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1120  hypothetical protein  30.03 
 
 		 689 aa  204  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0314  LppC family lipoprotein  30.46 
 
 		 672 aa  203  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.92899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0475  putative LppC lipoprotein  30.03 
 
 		 689 aa  203  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0539  LppC family lipoprotein  30.03 
 
 		 657 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0113  putative lipoprotein  27.88 
 
 		 653 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0308  LppC family lipoprotein  30.21 
 
 		 672 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0273  LppC putative lipoprotein  28.36 
 
 		 603 aa  195  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000539466  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2654  putative lipoprotein LppC  27.3 
 
 		 603 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0389  LppC family lipoprotein  28.48 
 
 		 607 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743997  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0300  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 619 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0740  LppC precursor  26.77 
 
 		 604 aa  191  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  27.83 
 
 		 595 aa  190  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  27.12 
 
 		 603 aa  190  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3692  LppC family lipoprotein  28.43 
 
 		 616 aa  190  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004501  LppC putative lipoprotein  27.76 
 
 		 555 aa  189  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000349106  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4099  LppC family lipoprotein  27.12 
 
 		 634 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4069  LppC family lipoprotein  26.96 
 
 		 634 aa  184  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0252  LppC family lipoprotein  28.21 
 
 		 624 aa  183  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0227  LppC family lipoprotein  27.74 
 
 		 634 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.238094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3624  LppC family lipoprotein  29.85 
 
 		 680 aa  182  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3989  LppC family lipoprotein  26.8 
 
 		 634 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3684  LppC family lipoprotein  26.71 
 
 		 627 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3880  LppC family lipoprotein  26.87 
 
 		 627 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0261  LppC family lipoprotein  26.83 
 
 		 628 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4187  LppC family lipoprotein  26.49 
 
 		 634 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  30.36 
 
 		 621 aa  178  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2394  putative lipoprotein-like protein  27.58 
 
 		 617 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.527391  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0590  LppC family lipoprotein  30.85 
 
 		 573 aa  171  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4251  LppC family lipoprotein  27.41 
 
 		 626 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.945552  hitchhiker  0.0000000616017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0352  LppC family lipoprotein  26.42 
 
 		 634 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03355  putative lipoprotein  26.14 
 
 		 666 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3693  LppC putative lipoprotein  26.21 
 
 		 658 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0676  LppC family lipoprotein  26.94 
 
 		 705 aa  151  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3451  LppC superfamily  31.02 
 
 		 680 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0551  LppC family lipoprotein  32.22 
 
 		 678 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3522  LppC superfamily  30.42 
 
 		 680 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3629  putative lipoprotein  31.81 
 
 		 678 aa  141  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3619  LppC family protein  31.02 
 
 		 680 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3453  LppC superfamily  31.02 
 
 		 680 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3559  LppC superfamily  31.02 
 
 		 680 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3339  putative lipoprotein  31.86 
 
 		 678 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0558  LppC family lipoprotein  32.22 
 
 		 678 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03014  hypothetical protein  31.86 
 
 		 678 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02965  hypothetical protein  31.86 
 
 		 678 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4466  putative lipoprotein  31.66 
 
 		 678 aa  140  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3625  putative lipoprotein  31.86 
 
 		 678 aa  140  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3442  putative lipoprotein  31.95 
 
 		 678 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1675  LppC family lipoprotein  28.9 
 
 		 576 aa  139  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4432  hypothetical protein  24.38 
 
 		 721 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1177  LppC family lipoprotein  24.77 
 
 		 677 aa  137  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.055728 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3584  LppC family lipoprotein  31.33 
 
 		 704 aa  137  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2282  putative lipoprotein-like protein  28.44 
 
 		 510 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1749  hypothetical protein  28.78 
 
 		 576 aa  135  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04379  LppC superfamily  28.23 
 
 		 576 aa  130  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3782  LppC family lipoprotein  30.54 
 
 		 682 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529967  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0316  Putative lipoprotein-like protein  27.6 
 
 		 612 aa  127  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.915463  hitchhiker  0.000474295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0143  lipoprotein, putative  27.6 
 
 		 612 aa  127  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1694  putative lipoprotein-like  25.28 
 
 		 525 aa  108  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.97529  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0264  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 378 aa  55.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241284  normal  0.379489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  26.96 
 
 		 356 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  21.98 
 
 		 393 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  21.32 
 
 		 395 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  20.8 
 
 		 402 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  20.65 
 
 		 402 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  21.3 
 
 		 390 aa  44.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  22.54 
 
 		 395 aa  44.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>