More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2705 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_31820  putative aminotransferase  87.17 
 
 
374 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437419  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2705  putative aminotransferase  100 
 
 
373 aa  764    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3031  putative aminotransferase  43.55 
 
 
387 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2584  putative aminotransferase  45.4 
 
 
374 aa  285  8e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975598  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0217  aminotransferase, class I and II  31.68 
 
 
367 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2627  aminotransferase class I and II  29.57 
 
 
395 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0082  aminotransferase class I and II  29.45 
 
 
390 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4751  aminotransferase class I and II  29.34 
 
 
383 aa  153  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000197662  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3654  aminotransferase class I and II  30.09 
 
 
411 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2051  aminotransferase class I and II  29.04 
 
 
394 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  33.95 
 
 
370 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3478  aminotransferase class I and II  27.7 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.53524  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  34.93 
 
 
362 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  31.98 
 
 
391 aa  138  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6129  aminotransferase class I and II  30.37 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.849535  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2352  aminotransferase class I and II  28.38 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.218999  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  30.12 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01039  histidinol-phosphate aminotransferase  29.12 
 
 
393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 
370 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
370 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  29.65 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  29.65 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  29.65 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  29.65 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  33.55 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  28.66 
 
 
370 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
370 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  32.75 
 
 
370 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
370 aa  132  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  32.07 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  28.71 
 
 
370 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  28.66 
 
 
370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  34.36 
 
 
374 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  31.7 
 
 
359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  27.61 
 
 
366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  31.07 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  26.97 
 
 
367 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  30.46 
 
 
370 aa  126  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  31.12 
 
 
363 aa  126  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  27.66 
 
 
366 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  27.66 
 
 
366 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01458  putative aminotransferase  26.74 
 
 
391 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13806  putative aminotransferase  30.91 
 
 
353 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918765  normal  0.733374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  27.66 
 
 
366 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  31.27 
 
 
369 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
355 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  27.66 
 
 
366 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  27.41 
 
 
373 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  32.22 
 
 
351 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  27.38 
 
 
358 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  27.36 
 
 
366 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
351 aa  123  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  30.56 
 
 
351 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  32.06 
 
 
355 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  27.36 
 
 
366 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0738  aminotransferase, class I and II  28.79 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  32.11 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  27.36 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  31.69 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3457  aminotransferase  28.36 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  27.73 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  31.44 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  26.99 
 
 
366 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  28.71 
 
 
367 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  29.67 
 
 
358 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  31.95 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  31.71 
 
 
370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  32.26 
 
 
376 aa  119  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  27.05 
 
 
366 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  27.58 
 
 
386 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
370 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  28.91 
 
 
365 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  28.99 
 
 
392 aa  119  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 
366 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  27.57 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  31.89 
 
 
374 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
360 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  30.61 
 
 
365 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  33.63 
 
 
373 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  31.74 
 
 
365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  28.18 
 
 
369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  30.88 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  27.9 
 
 
363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  31.74 
 
 
365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  31.69 
 
 
344 aa  117  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  28.82 
 
 
389 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  28.74 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  27.79 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2950  aminotransferase  35.14 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  32.42 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2935  aminotransferase  35.14 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  29.81 
 
 
362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  30.63 
 
 
394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2979  aminotransferase  35.14 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  26.61 
 
 
375 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  29.82 
 
 
371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5070  putative aminotransferase  30.15 
 
 
358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>