45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3315 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  307  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2369  hypothetical protein  83.87 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  72.37 
 
 		 163 aa  222  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  74.34 
 
 		 166 aa  205  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  76.22 
 
 		 165 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.424695 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1160  hypothetical protein  68.79 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.541838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1310  hypothetical protein  66.2 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  64.79 
 
 		 188 aa  178  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  64.08 
 
 		 188 aa  175  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  62.86 
 
 		 170 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3418  hypothetical protein  76.99 
 
 		 124 aa  160  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  65.03 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  42.67 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  45.99 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  44.53 
 
 		 185 aa  120  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0414  hypothetical protein  44.76 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697482  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4460  hypothetical protein  48.23 
 
 		 163 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  45 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1574  hypothetical protein  57.45 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00494576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3686  hypothetical protein  44.6 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3270  hypothetical protein  45.52 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.660762  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1431  hypothetical protein  37.98 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1345  hypothetical protein  39.58 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.77021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1644  hypothetical protein  39.58 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  36.77 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  34.07 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  32.12 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  32.12 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  29.77 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  33.61 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  31.78 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  29.63 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  29.79 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  30.71 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  32.73 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  32.33 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  30.84 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0901  hypothetical protein  29.85 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  27.74 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  27.41 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  29.85 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  29.69 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  31.15 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  27.42 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>