74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1328 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1328  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  1062    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0459237  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.12 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  24.22 
 
 		 326 aa  70.1  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  24.38 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  22.95 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  24.29 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.03 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.95 
 
 		 325 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  22.31 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  25.21 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  24.79 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2611  hypothetical protein  34.07 
 
 		 527 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0107  hypothetical protein  22.06 
 
 		 527 aa  56.2  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138726 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  24.28 
 
 		 330 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1256  nucleotidyl transferase  38.1 
 
 		 257 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  26.67 
 
 		 247 aa  51.6  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  22.41 
 
 		 330 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1612  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.89 
 
 		 290 aa  51.2  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  24.57 
 
 		 336 aa  51.6  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  20.99 
 
 		 324 aa  51.2  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  23.56 
 
 		 384 aa  50.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  25.33 
 
 		 329 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.08 
 
 		 349 aa  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3391  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  30.99 
 
 		 272 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3106  hypothetical protein  29.77 
 
 		 506 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1801  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 507 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.679087  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0439  nucleotidyltransferase family protein  29.58 
 
 		 269 aa  48.5  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0717803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1377  putative UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.97 
 
 		 238 aa  48.5  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  29.89 
 
 		 254 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0800  nucleotidyl transferase  25.27 
 
 		 280 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0382  nucleotidyltransferase family protein  29.58 
 
 		 269 aa  48.5  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  24.85 
 
 		 388 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  30.09 
 
 		 414 aa  47.8  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  22.95 
 
 		 247 aa  47.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2260  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  35.94 
 
 		 258 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.478249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  24.25 
 
 		 338 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  27.27 
 
 		 241 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0205  nucleotidyl transferase  28.4 
 
 		 262 aa  46.2  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  20.96 
 
 		 393 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2056  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.89 
 
 		 288 aa  46.2  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  27.12 
 
 		 245 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2384  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  37.88 
 
 		 256 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8649  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.32 
 
 		 299 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1121  UDP-glucose pyrophosphorylase  24.81 
 
 		 295 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2156  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  35.94 
 
 		 284 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2905  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.89 
 
 		 310 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0966738  hitchhiker  0.0003639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4514  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.67 
 
 		 294 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182838  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0372  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.12 
 
 		 304 aa  44.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2576  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.64 
 
 		 288 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2524  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.64 
 
 		 288 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4970  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  36.51 
 
 		 279 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3930  nucleotidyl transferase  22.78 
 
 		 284 aa  44.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0385  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  34.38 
 
 		 257 aa  44.3  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4956  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.47 
 
 		 297 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000197493  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5449  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.47 
 
 		 293 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.784502  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3268  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.12 
 
 		 296 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2837  nucleotidyl transferase  31.75 
 
 		 258 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.913671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2073  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.67 
 
 		 296 aa  44.3  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0724  hypothetical protein  54.35 
 
 		 351 aa  44.3  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1690  nucleotidyl transferase  32.81 
 
 		 257 aa  44.3  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2657  nucleotidyl transferase  35.94 
 
 		 256 aa  44.3  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0062  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  34.92 
 
 		 257 aa  43.9  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.191265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  26.27 
 
 		 241 aa  43.9  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0301  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 		 512 aa  43.9  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.141921  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3094  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 256 aa  43.9  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3529  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.41 
 
 		 295 aa  43.9  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.58 
 
 		 358 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3188  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.18 
 
 		 301 aa  43.9  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.492305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.18 
 
 		 356 aa  43.9  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4603  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  32.81 
 
 		 256 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.803546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12931  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  34.92 
 
 		 253 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126471  hitchhiker  0.00767012 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0611  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.46 
 
 		 292 aa  43.5  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1563  nucleotidyl transferase  35.94 
 
 		 257 aa  43.5  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.436839 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0331  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  29.69 
 
 		 257 aa  43.5  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0192457  normal  0.967948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>