299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1788 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1788  prenyltransferase  100 
 
 
288 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05111  prenyltransferase  97.92 
 
 
287 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04571  prenyltransferase  61.71 
 
 
297 aa  335  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05191  prenyltransferase  57.25 
 
 
295 aa  318  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.659652  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05121  prenyltransferase  57.34 
 
 
302 aa  316  3e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0317979  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0456  prenyltransferase  57.24 
 
 
302 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.199404  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04811  prenyltransferase  55.59 
 
 
302 aa  312  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374006  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1740  prenyltransferase  55.83 
 
 
296 aa  310  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06581  prenyltransferase  59.48 
 
 
297 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0622  prenyltransferase  54.06 
 
 
299 aa  287  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.2783  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3531  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.34 
 
 
290 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0232  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.43 
 
 
291 aa  199  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.408398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4142  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  40.29 
 
 
293 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.356002  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3733  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.07 
 
 
292 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000311091  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3679  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.07 
 
 
292 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  38.87 
 
 
301 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1159  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.57 
 
 
294 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1964  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.16 
 
 
310 aa  185  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.855973  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3595  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  35.9 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12269  predicted protein  34.17 
 
 
300 aa  139  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1381  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.7 
 
 
282 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0413  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.77 
 
 
296 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1486  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.61 
 
 
323 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6135  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.05 
 
 
296 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.05 
 
 
296 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1385  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.7 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0371  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  33.61 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.156009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0380  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.61 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0619  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  34.17 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5604  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.36 
 
 
296 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0645  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  34.17 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1016  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.97 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87025  Para-hydroxybenzoate--polyprenyltransferase, mitochondrial precursor (PHB:polyprenyltransferase)  33.68 
 
 
285 aa  132  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02871  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.5 
 
 
299 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0653  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  40.1 
 
 
340 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110294  normal  0.440734 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43450  predicted protein  31.01 
 
 
404 aa  132  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0229957  normal  0.0842835 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2611  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.92 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2330  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  33.95 
 
 
295 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4280  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.45 
 
 
290 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.91 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03912  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.45 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3953  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  33.45 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03872  hypothetical protein  33.45 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5521  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.45 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272125  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.45 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3815  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  34.18 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3988  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.45 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4593  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.45 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.568331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4502  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.45 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3401  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  31.94 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5064  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  33.62 
 
 
286 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5031  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.85 
 
 
296 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0474  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.75 
 
 
286 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  31.45 
 
 
284 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4399  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  33.8 
 
 
284 aa  128  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2519  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  34.87 
 
 
287 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  0.917266 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0463  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.1 
 
 
293 aa  128  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0140  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.1 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.654949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1286  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.8 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2048  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.1 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3837  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.47 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0373903  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.91 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3527  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  31.82 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3316  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.8 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5476  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  34.62 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3350  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.8 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0697  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  32.92 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370156  normal  0.206083 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  33.33 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2582  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.8 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0245  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  32.92 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0729  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  32.92 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262552  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.8 
 
 
316 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.38401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3361  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.8 
 
 
316 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230126  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0312  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.8 
 
 
370 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1173  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.8 
 
 
370 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.13 
 
 
285 aa  125  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.91 
 
 
288 aa  125  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0054  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.61 
 
 
296 aa  125  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0138918  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0596  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  34.35 
 
 
295 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0326  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  34.67 
 
 
289 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0277634 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.05 
 
 
286 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4409  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.1 
 
 
296 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0458215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0511  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.85 
 
 
287 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2657  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  32.07 
 
 
287 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.62 
 
 
287 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3680  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.02 
 
 
296 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791874  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.07 
 
 
342 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48510  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  34.15 
 
 
295 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.826372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0244  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.1 
 
 
289 aa  122  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.17 
 
 
319 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.17 
 
 
322 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.7 
 
 
327 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0965  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.61 
 
 
299 aa  122  8e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271339  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5318  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.14 
 
 
296 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5226  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.14 
 
 
296 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2803  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.95 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3773  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.22 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.11 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3863  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.22 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.508575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0572  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  34.3 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>