More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0463 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0463  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  100 
 
 
293 aa  578  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0413  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  67.35 
 
 
296 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2611  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  66.55 
 
 
290 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0697  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  61.92 
 
 
287 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370156  normal  0.206083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2519  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  63.44 
 
 
287 aa  358  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  0.917266 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0245  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  61.57 
 
 
287 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0729  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  61.57 
 
 
287 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2657  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  61.21 
 
 
287 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3815  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  60.85 
 
 
287 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0619  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  60.85 
 
 
290 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0054  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  63.1 
 
 
296 aa  350  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0138918  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0645  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  60.5 
 
 
290 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1286  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  60.78 
 
 
310 aa  343  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0824  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  65.97 
 
 
292 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1173  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  59.43 
 
 
370 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0312  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  59.43 
 
 
370 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  59.43 
 
 
316 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.38401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3361  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  59.43 
 
 
316 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230126  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3316  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  59.43 
 
 
287 aa  331  8e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3350  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  59.43 
 
 
287 aa  331  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0715  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  64.87 
 
 
287 aa  331  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.959768 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2582  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  59.43 
 
 
287 aa  331  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3983  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  64.16 
 
 
287 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2803  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  61.05 
 
 
285 aa  318  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2509  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  60.07 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2921  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  60.57 
 
 
280 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472236  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2939  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  62.9 
 
 
294 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105208  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2686  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  63.96 
 
 
291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1503  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  58.87 
 
 
287 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1786  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  57.8 
 
 
287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1217  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  56.18 
 
 
285 aa  300  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.45215  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0128  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  57.04 
 
 
289 aa  292  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02871  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.9 
 
 
299 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0044  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.8 
 
 
299 aa  286  4e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3252  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  57.4 
 
 
298 aa  286  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0965  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.35 
 
 
299 aa  285  5e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271339  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0053  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.16 
 
 
299 aa  285  5e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0716312  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2048  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.7 
 
 
287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0140  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  51.06 
 
 
287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.654949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.7 
 
 
286 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5064  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  55.09 
 
 
286 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0380  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.3 
 
 
290 aa  278  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0371  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  52.3 
 
 
290 aa  278  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.156009  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4409  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.99 
 
 
296 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0458215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1018  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  52.13 
 
 
290 aa  276  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2330  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  52.8 
 
 
295 aa  275  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.93 
 
 
284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.3 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  48.21 
 
 
284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.95 
 
 
288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3808  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.52 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.466325  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3837  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.95 
 
 
299 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0373903  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5604  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.81 
 
 
296 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1336  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  56.34 
 
 
292 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3595  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  50.72 
 
 
294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5031  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.18 
 
 
296 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.18 
 
 
286 aa  269  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4280  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.7 
 
 
290 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0596  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.04 
 
 
295 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0474  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.33 
 
 
286 aa  268  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4593  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.7 
 
 
290 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.568331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03912  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.7 
 
 
290 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3953  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  50.7 
 
 
290 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4502  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.7 
 
 
290 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.7 
 
 
290 aa  268  8.999999999999999e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5521  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.7 
 
 
290 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272125  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4399  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  47.35 
 
 
284 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03872  hypothetical protein  50.7 
 
 
290 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3988  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.7 
 
 
290 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.6 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.36 
 
 
285 aa  265  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5476  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  49.47 
 
 
296 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1016  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  51.59 
 
 
297 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.52 
 
 
296 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5318  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.36 
 
 
296 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1613  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  52.63 
 
 
288 aa  261  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0142555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5226  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.36 
 
 
296 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2283  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  49.65 
 
 
289 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5365  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50 
 
 
296 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.346697 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00072  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.38 
 
 
286 aa  259  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0156  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.28 
 
 
296 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6135  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.8 
 
 
296 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3891  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50 
 
 
286 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3401  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.82 
 
 
287 aa  255  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.99 
 
 
286 aa  255  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3817  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.65 
 
 
286 aa  255  7e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4014  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.65 
 
 
286 aa  255  7e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0474  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.45 
 
 
286 aa  255  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.45 
 
 
286 aa  255  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.393254  normal  0.712542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0442  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.65 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3680  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  51.22 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0511  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.74 
 
 
287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48510  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.45 
 
 
295 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.826372  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0470  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.23 
 
 
286 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517028  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0326  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  51.79 
 
 
289 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0277634 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0244  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.6 
 
 
289 aa  251  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0126  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  48.35 
 
 
287 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4426  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.41 
 
 
290 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000119511 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0067  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  48.53 
 
 
273 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.209668  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4577  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.41 
 
 
290 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677427  normal  0.0427983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>