More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1016 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1016  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  100 
 
 
297 aa  591  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0371  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  86.62 
 
 
290 aa  497  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.156009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0380  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  86.62 
 
 
290 aa  497  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0596  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  67.24 
 
 
295 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2330  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  66.09 
 
 
295 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0474  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  63.6 
 
 
286 aa  348  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1613  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  62.68 
 
 
288 aa  345  5e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0142555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5064  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  64.18 
 
 
286 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3680  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  61.46 
 
 
296 aa  340  2e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791874  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0326  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  62.5 
 
 
289 aa  329  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0277634 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3743  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  57.28 
 
 
307 aa  309  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.33566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2519  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  55.09 
 
 
287 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  0.917266 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1286  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  55.24 
 
 
310 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2657  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.07 
 
 
287 aa  295  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3815  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.19 
 
 
287 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.55 
 
 
316 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.38401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3361  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.55 
 
 
316 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230126  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1173  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.55 
 
 
370 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0312  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.55 
 
 
370 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0245  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.13 
 
 
287 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0697  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.13 
 
 
287 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370156  normal  0.206083 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0729  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.13 
 
 
287 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2582  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.96 
 
 
287 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0619  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.48 
 
 
290 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3350  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.61 
 
 
287 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3316  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.61 
 
 
287 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0715  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  55.21 
 
 
287 aa  289  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.959768 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0645  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.13 
 
 
290 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3983  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.51 
 
 
287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2803  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  55.4 
 
 
285 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0413  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.2 
 
 
296 aa  277  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0054  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.07 
 
 
296 aa  277  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0138918  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2939  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  55.22 
 
 
294 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105208  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0824  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  56.79 
 
 
292 aa  266  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2611  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.22 
 
 
290 aa  263  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2509  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.55 
 
 
291 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2921  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.61 
 
 
280 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472236  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0463  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.59 
 
 
293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2686  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.15 
 
 
291 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1786  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  46.83 
 
 
287 aa  247  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1503  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  48.59 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2048  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  43.75 
 
 
287 aa  242  5e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3252  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.89 
 
 
298 aa  241  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0140  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  44.06 
 
 
287 aa  241  7e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.654949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00072  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.68 
 
 
286 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  47.12 
 
 
296 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  47.7 
 
 
286 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5604  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.76 
 
 
296 aa  238  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.83 
 
 
286 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02871  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.21 
 
 
299 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.68 
 
 
284 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6135  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.76 
 
 
296 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0053  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.33 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0716312  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0044  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.33 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0126  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  43.59 
 
 
287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.84 
 
 
284 aa  232  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.85 
 
 
285 aa  232  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5318  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.4 
 
 
296 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5476  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  44.24 
 
 
296 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0156  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.68 
 
 
296 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5226  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.4 
 
 
296 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.91 
 
 
286 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5365  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.04 
 
 
296 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.346697 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3595  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  45.17 
 
 
294 aa  229  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5031  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  43.88 
 
 
296 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0965  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.07 
 
 
299 aa  229  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03912  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.52 
 
 
290 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3953  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  44.52 
 
 
290 aa  227  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4502  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.52 
 
 
290 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03872  hypothetical protein  44.52 
 
 
290 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.72 
 
 
288 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4280  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.52 
 
 
290 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.52 
 
 
290 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5521  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.52 
 
 
290 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272125  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4593  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.52 
 
 
290 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.568331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3988  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.52 
 
 
290 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4399  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  42.7 
 
 
284 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.48 
 
 
286 aa  225  7e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3837  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.67 
 
 
299 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0373903  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0511  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.01 
 
 
287 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4409  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.24 
 
 
296 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0458215 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48510  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.04 
 
 
295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.826372  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.13 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3808  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.11 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.466325  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1217  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.48 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.45215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0244  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.18 
 
 
289 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4014  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.56 
 
 
286 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3891  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.56 
 
 
286 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3527  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.77 
 
 
294 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3817  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.56 
 
 
286 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0442  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.56 
 
 
286 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0470  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.04 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517028  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4577  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.58 
 
 
290 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677427  normal  0.0427983 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4628  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.58 
 
 
290 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133714 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0744  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  45.45 
 
 
300 aa  216  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000571942  hitchhiker  0.00000066778 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4576  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.58 
 
 
290 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4491  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.58 
 
 
290 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4426  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.58 
 
 
290 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000119511 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0592  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  45.45 
 
 
300 aa  216  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1018  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  44.17 
 
 
290 aa  215  9e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>