More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1301 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_21741  hypothetical protein  98.3 
 
 
352 aa  715    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.349556  normal  0.259448 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1301  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  728    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29911  hypothetical protein  57.1 
 
 
368 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18281  hypothetical protein  58.31 
 
 
352 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2289  hypothetical protein  54.84 
 
 
356 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2660  hypothetical protein  52.65 
 
 
356 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0870271  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4534  hypothetical protein  45.09 
 
 
359 aa  299  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1680  hypothetical protein  45.78 
 
 
357 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.99598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1598  hypothetical protein  44.44 
 
 
351 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4332  hypothetical protein  42.4 
 
 
350 aa  276  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2471  hypothetical protein  42.82 
 
 
351 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3637  hypothetical protein  42.82 
 
 
351 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0934  hypothetical protein  39.05 
 
 
353 aa  245  9e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.464361  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  25.8 
 
 
346 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1586  Anthranilate phosphoribosyltransferase  23.91 
 
 
361 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0088  glycosyl transferase family 3  23.24 
 
 
368 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1762  Anthranilate phosphoribosyltransferase  22.42 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.93 
 
 
341 aa  94  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3498  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.57 
 
 
349 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432784  hitchhiker  0.000262957 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2892  Anthranilate phosphoribosyltransferase  24.78 
 
 
355 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0513  Anthranilate phosphoribosyltransferase  25.29 
 
 
355 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0459  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.26 
 
 
349 aa  92.8  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4702  Glycosyl transferase, family 3-like protein  27.92 
 
 
378 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2700  anthranilate phosphoribosyltransferase  21.94 
 
 
342 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3126  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.12 
 
 
345 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal  0.587762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2761  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.12 
 
 
345 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1029  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.91 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3180  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.71 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0270  anthranilate phosphoribosyltransferase-like protein  22.47 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4376  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.92 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.955591  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2176  Glycosyl transferase, family 3-like protein  21.91 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.261801  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2884  anthranilate phosphoribosyltransferase  25 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3025  anthranilate phosphoribosyltransferase  21.67 
 
 
369 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0877823  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3235  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.03 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0359  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.82 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0585  anthranilate phosphoribosyltransferase  21.02 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0369  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.82 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0769  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.82 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0531  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.38 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.69558  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0646  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.38 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3577  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.38 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582047  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3585  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.38 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2797  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.01 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3558  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.38 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701795  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0942  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.38 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1912  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.38 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2573  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.69 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0532  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.69 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.38 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.911757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  26.89 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3619  anthranilate phosphoribosyltransferase  19.75 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2862  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.06 
 
 
343 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4452  anthranilate phosphoribosyltransferase  21.34 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336812  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.12 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0461  anthranilate phosphoribosyltransferase  20 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0437  anthranilate phosphoribosyltransferase  20 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  27.31 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1734  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.07 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66057  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2911  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.06 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2223  anthranilate phosphoribosyltransferase  21.17 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2142  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.64 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5575  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.28 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1980  glycosyl transferase family protein  23.19 
 
 
298 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0578  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.95 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5395  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.01 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  26.12 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3461  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.89 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1046  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.39 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  22.99 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.993844 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04003  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.38 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.66 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1273  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.32 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  25.19 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  22.73 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  22.73 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1483  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.32 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  22.73 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  22.73 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  26.47 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  22.73 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3650  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.5 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2799  anthranilate phosphoribosyltransferase  21.78 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  21.73 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3602  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.61 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  21.23 
 
 
339 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  20.81 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  22.73 
 
 
320 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.7 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3476  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.26 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.216089  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.81 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  25.94 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  22.85 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3215  anthranilate phosphoribosyltransferase  21.19 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1408  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.53 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.457707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  22.69 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  25.63 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1638  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.1 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  25.63 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>