More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85387 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_85387  predicted protein  100 
 
 
430 aa  884    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.424834 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04750  adenylosuccinate synthase, putative  64.3 
 
 
430 aa  558  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.154045  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00893  Adenylosuccinate synthetase (EC 6.3.4.4) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1T5]  57.18 
 
 
424 aa  485  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26256  adenylosuccinate synthetase  52.93 
 
 
526 aa  468  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19549  predicted protein  52 
 
 
428 aa  458  1e-127  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.277088 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  48.35 
 
 
428 aa  414  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  47.18 
 
 
433 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 
425 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2354  adenylosuccinate synthetase  45.65 
 
 
426 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3093  adenylosuccinate synthetase  46.82 
 
 
424 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000909449  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  45.86 
 
 
429 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2125  Adenylosuccinate synthase  43.53 
 
 
423 aa  376  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.9394  normal  0.847855 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  46.84 
 
 
428 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  46.84 
 
 
428 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1347  adenylosuccinate synthetase  44.55 
 
 
428 aa  377  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2909  Adenylosuccinate synthetase  46.08 
 
 
429 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270112  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0271  adenylosuccinate synthetase  44.96 
 
 
427 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  44.92 
 
 
434 aa  373  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0492  adenylosuccinate synthetase  46.46 
 
 
428 aa  368  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35160  Adenylosuccinate synthetase  44.84 
 
 
429 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  44.86 
 
 
433 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0115  adenylosuccinate synthase  43.66 
 
 
433 aa  366  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0046  adenylosuccinate synthetase  45.15 
 
 
426 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  44.68 
 
 
434 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  43.5 
 
 
434 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  44.44 
 
 
435 aa  366  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0203  adenylosuccinate synthetase  44.37 
 
 
427 aa  364  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0735  adenylosuccinate synthetase  45.33 
 
 
447 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.772152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3012  adenylosuccinate synthetase  42.72 
 
 
427 aa  364  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0951897  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0706  adenylosuccinate synthetase  45.33 
 
 
447 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  43.02 
 
 
430 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2419  adenylosuccinate synthetase  44.44 
 
 
424 aa  363  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000351382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0389  Adenylosuccinate synthase  43.43 
 
 
427 aa  362  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899335  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2221  adenylosuccinate synthetase  43.95 
 
 
423 aa  363  5.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  44.42 
 
 
431 aa  362  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3138  adenylosuccinate synthetase  44.13 
 
 
430 aa  362  8e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32892  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1671  adenylosuccinate synthetase  44.84 
 
 
416 aa  361  1e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1490  adenylosuccinate synthetase  44.84 
 
 
416 aa  361  1e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1846  adenylosuccinate synthetase  44.84 
 
 
416 aa  361  1e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  44.52 
 
 
434 aa  360  2e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  43.97 
 
 
434 aa  360  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  43.29 
 
 
416 aa  360  2e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3524  adenylosuccinate synthetase  44.19 
 
 
444 aa  360  3e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2409  adenylosuccinate synthetase  45.09 
 
 
444 aa  359  5e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0382051  normal  0.0691331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4635  adenylosuccinate synthetase  44.55 
 
 
427 aa  359  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11510  Adenylosuccinate synthetase  43.46 
 
 
434 aa  358  7e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  43.76 
 
 
428 aa  358  9e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0010  adenylosuccinate synthetase  43.36 
 
 
427 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000465701  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08766  adenylosuccinate synthetase  43.26 
 
 
423 aa  358  9.999999999999999e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0287341  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0368  adenylosuccinate synthetase  43.97 
 
 
416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.361154  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2309  adenylosuccinate synthetase  42.56 
 
 
427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0139427  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3300  adenylosuccinate synthetase  42.82 
 
 
428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000123723  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1913  adenylosuccinate synthetase  43.3 
 
 
430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  43.47 
 
 
427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2053  adenylosuccinate synthetase  43.85 
 
 
447 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0176  adenylosuccinate synthetase  44.71 
 
 
427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386224  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0211  adenylosuccinate synthetase  42.96 
 
 
427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0025  adenylosuccinate synthetase  43.69 
 
 
426 aa  356  5e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.993316  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4740  adenylosuccinate synthetase  43.46 
 
 
449 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.947935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4368  adenylosuccinate synthetase  42.49 
 
 
427 aa  355  6.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.335736  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3868  adenylosuccinate synthetase  42.62 
 
 
442 aa  355  6.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1701  adenylosuccinate synthetase  45.96 
 
 
431 aa  355  7.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.401877  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1460  adenylosuccinate synthetase  43.09 
 
 
427 aa  355  7.999999999999999e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0524  adenylosuccinate synthetase  44.44 
 
 
432 aa  354  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0248  adenylosuccinate synthetase  42.52 
 
 
423 aa  355  1e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2963  adenylosuccinate synthetase  43.63 
 
 
428 aa  354  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17225  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08920  adenylosuccinate synthetase  42.45 
 
 
432 aa  353  4e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4344  adenylosuccinate synthetase  42.33 
 
 
432 aa  353  4e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05071  adenylosuccinate synthetase  44.03 
 
 
437 aa  352  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  42.06 
 
 
427 aa  352  8e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1280  adenylosuccinate synthetase  43.84 
 
 
427 aa  351  1e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2270  adenylosuccinate synthetase  42.86 
 
 
418 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2533  adenylosuccinate synthase  42.86 
 
 
426 aa  351  1e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000265596  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0370  adenylosuccinate synthetase  43.66 
 
 
416 aa  351  1e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0409344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23100  Adenylosuccinate synthase  45.41 
 
 
428 aa  350  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3282  adenylosuccinate synthetase  42.92 
 
 
437 aa  350  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00809393  normal  0.019729 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  42.52 
 
 
430 aa  350  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  42.69 
 
 
430 aa  350  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1202  adenylosuccinate synthetase  43.46 
 
 
425 aa  350  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.609737  normal  0.550164 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3410  adenylosuccinate synthetase  43.54 
 
 
428 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4007  adenylosuccinate synthetase  43.6 
 
 
429 aa  349  6e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000037837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0990  adenylosuccinate synthetase  43.19 
 
 
429 aa  349  6e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1818  adenylosuccinate synthetase  42.34 
 
 
430 aa  348  9e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3539  adenylosuccinate synthetase  43.06 
 
 
428 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07421  adenylosuccinate synthetase  43.33 
 
 
439 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3635  adenylosuccinate synthetase  42.96 
 
 
429 aa  345  6e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.336244 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1958  adenylosuccinate synthetase  43.87 
 
 
425 aa  345  7e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1927  adenylosuccinate synthetase  43.76 
 
 
415 aa  345  1e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  42.65 
 
 
431 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2416  adenylosuccinate synthetase  43.4 
 
 
428 aa  344  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0522  adenylosuccinate synthetase  42.22 
 
 
429 aa  344  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1271  adenylosuccinate synthetase  43.46 
 
 
429 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0691  adenylosuccinate synthetase  42.46 
 
 
439 aa  343  4e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0464  adenylosuccinate synthetase  43.74 
 
 
423 aa  342  7e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1126  adenylosuccinate synthetase  44.19 
 
 
436 aa  342  8e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00711413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  42.62 
 
 
432 aa  342  9e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  41.47 
 
 
435 aa  341  1e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0667  adenylosuccinate synthetase  42.04 
 
 
429 aa  341  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  42.36 
 
 
430 aa  341  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0390  adenylosuccinate synthetase  41.57 
 
 
429 aa  341  1e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168216  decreased coverage  0.00000000000000193534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>