21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82260 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_82260  Defective Cell Wall  100 
 
 		 456 aa  935    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87647  filamentous growth, cell polarity and elongation  48.76 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0779886 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10345  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  43.2 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20974 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08421  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  39.66 
 
 		 452 aa  279  6e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.259019  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00393  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  34.81 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.388757  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03049  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  36.68 
 
 		 499 aa  242  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00383  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  31.41 
 
 		 286 aa  142  9e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.965363  normal  0.606284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  27.22 
 
 		 386 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  28.79 
 
 		 492 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  25.64 
 
 		 614 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  30.48 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  26.04 
 
 		 363 aa  79.7  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  26.39 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06472  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  32.62 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0842136 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  38.46 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42049  predicted protein  31.91 
 
 		 422 aa  57  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39360  predicted protein  26.76 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6932  glycoside hydrolase family 76  23.74 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  25.26 
 
 		 358 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59845  predicted protein  24.82 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.146296  normal  0.132245 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>