28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_74268 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_03029  AP-1 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08970)  50.27 
 
 		 766 aa  670    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0965274 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74268  beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex  100 
 
 		 736 aa  1500    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  47.03 
 
 		 755 aa  616  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03830  clathrin binding protein, putative  47.25 
 
 		 732 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119607  Beta adaptin-like protein  42.21 
 
 		 551 aa  427  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04170  vesicle-mediated transport-related protein, putative  38.53 
 
 		 696 aa  397  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.567808  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05950  AP-2 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10340)  36.55 
 
 		 717 aa  368  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84899  predicted protein  33.96 
 
 		 697 aa  280  7e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54730  predicted protein  29.4 
 
 		 805 aa  268  4e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.442884  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86921  predicted protein  26.48 
 
 		 785 aa  223  7e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00165  AP-3 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11360)  26.06 
 
 		 841 aa  161  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.318304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44118  predicted protein  27.9 
 
 		 676 aa  151  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.139737  normal  0.0310937 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06410  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  22.96 
 
 		 835 aa  126  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_54789  predicted protein  25.5 
 
 		 1205 aa  122  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88879  clathrin assembly complex beta adaptin component  23.9 
 
 		 817 aa  108  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.789212 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04207  AP-1 adaptor complex subunit gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06030)  19.52 
 
 		 839 aa  56.6  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01870  gamma-adaptin, putative  26.75 
 
 		 854 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.543816  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49385  predicted protein  22.88 
 
 		 936 aa  51.2  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0497486  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82880  predicted protein  23 
 
 		 812 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44719  predicted protein  24.43 
 
 		 895 aa  48.9  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00567496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13511  predicted protein  21.2 
 
 		 939 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16891  predicted protein  18.43 
 
 		 450 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  26 
 
 		 493 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.52 
 
 		 395 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  25.52 
 
 		 395 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  18.97 
 
 		 622 aa  45.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00660  vesicle-mediated transport-related protein, putative  21.08 
 
 		 1063 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119532  Coatomer gamma subunit  19.53 
 
 		 868 aa  44.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>