17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39360 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_39360  predicted protein  100 
 
 		 400 aa  835    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42049  predicted protein  28.24 
 
 		 422 aa  139  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59845  predicted protein  32 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.146296  normal  0.132245 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  29.09 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  25 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  23.91 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  29.09 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  24.66 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  28.41 
 
 		 380 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  27.27 
 
 		 614 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82260  Defective Cell Wall  26.76 
 
 		 456 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.208592 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03049  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  24.47 
 
 		 499 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00393  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  24.85 
 
 		 464 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.388757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  25 
 
 		 492 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10345  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  29.69 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.20974 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87647  filamentous growth, cell polarity and elongation  27.97 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0779886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  26.06 
 
 		 380 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>