27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56440 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_56440  predicted protein  100 
 
 		 381 aa  746    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143287  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02620  ATP-dependent protein binding protein, putative  96.05 
 
 		 457 aa  719    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.675175  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26775  predicted protein  94.74 
 
 		 381 aa  716    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.246386 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02000  Polyubiquitin Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A2RVC1]  97.05 
 
 		 305 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73878  predicted protein  96.05 
 
 		 305 aa  577  1e-164  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49037  predicted protein  98.7 
 
 		 205 aa  158  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.227724  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22043  ubiquitin extension protein 1/2  98.7 
 
 		 128 aa  155  8e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03330  ubiquitin-carboxy extension protein fusion, putative  94.81 
 
 		 129 aa  151  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32483  Ribosomal protein S27a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  93.51 
 
 		 150 aa  149  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079306  decreased coverage  0.00789821 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27118  ubiquitin extension protein 3  100 
 
 		 155 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16428  Ribosomal protein L40, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  85.71 
 
 		 128 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.328088  normal  0.0552744 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04872  Putative uncharacterized proteinUBI1 ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV58]  97.14 
 
 		 154 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.171083 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73842  Ubiquitin/40S ribosomal protein S27a fusion  95.71 
 
 		 151 aa  137  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3361  ubiquitin  82.67 
 
 		 360 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4710  ubiquitin  79.73 
 
 		 287 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54323  ubiquitin-like protein  50.75 
 
 		 268 aa  111  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40601  predicted protein  59.46 
 
 		 77 aa  97.4  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.684929  normal  0.192753 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06179  hypothetical protein similar to SPBC24C6.01c (Broad)  57.14 
 
 		 81 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.92156 
 
 
-
 
NC_006686  CND03060  ribosomal chaperone, putative  57.53 
 
 		 159 aa  91.7  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.473812  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34540  predicted protein  53.25 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02170  conserved hypothetical protein  27.21 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04440  ribosomal chaperone, putative  51.56 
 
 		 88 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0863999  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85034  predicted protein  35.92 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.737973  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01010  conserved hypothetical protein  31.68 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252754  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07500  uv excision repair protein rhp23, putative  32.39 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.40464  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02304  UV excision repair protein (RadW), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06040)  34.92 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0290745  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02170  hypothetical protein  26.47 
 
 		 319 aa  43.5  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>