35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_53929 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  100 
 
 		 490 aa  998    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  30.15 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150941 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  33.75 
 
 		 735 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  31.3 
 
 		 900 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  28.04 
 
 		 314 aa  97.4  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  29.61 
 
 		 338 aa  89.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  27.3 
 
 		 313 aa  87.8  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  28.68 
 
 		 321 aa  87.4  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  28.61 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  30.1 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  27.13 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  27.39 
 
 		 303 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  28.68 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  29 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  28.22 
 
 		 322 aa  63.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  26.83 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  26.82 
 
 		 336 aa  60.1  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  26.36 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  26.04 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  22.57 
 
 		 340 aa  55.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  23.04 
 
 		 340 aa  53.5  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  27.31 
 
 		 290 aa  53.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  28.27 
 
 		 306 aa  50.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  28.27 
 
 		 306 aa  50.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  58.97 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  31.18 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  29.48 
 
 		 347 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  27.49 
 
 		 295 aa  47.4  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  26.86 
 
 		 289 aa  47  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  29.79 
 
 		 292 aa  47  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  56.41 
 
 		 289 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  25.5 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  68.75 
 
 		 289 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  25.11 
 
 		 276 aa  45.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  62.5 
 
 		 316 aa  43.9  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>