More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1172 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1172  iron-sulfur cluster binding protein, putative  100 
 
 		 428 aa  897    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3005  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.94 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  55.45 
 
 		 465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5745  protein of unknown function DUF162  52.22 
 
 		 458 aa  465  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00670612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4211  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.41 
 
 		 467 aa  468  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140859  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2947  protein of unknown function DUF162  52.69 
 
 		 458 aa  465  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2997  hypothetical protein  54.33 
 
 		 457 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2737  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.8 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1374  hypothetical protein  54.33 
 
 		 465 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.817438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  53.05 
 
 		 457 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3174  protein of unknown function DUF162  52.96 
 
 		 458 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2442  iron-sulfur cluster-binding protein  54.5 
 
 		 466 aa  451  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.8 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3931  protein of unknown function DUF162  50 
 
 		 459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.463483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1337  hypothetical protein  54.33 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1519  iron-sulfur cluster-binding protein  54.57 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.33 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3923  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.16 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3010  protein of unknown function DUF162  54.33 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2907  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  54.57 
 
 		 464 aa  441  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1351  hypothetical protein  54.1 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1436  hypothetical protein  52.94 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.87 
 
 		 462 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3066  protein of unknown function DUF162  52.48 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0696  protein of unknown function DUF162  52 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2646  protein of unknown function DUF162  49.07 
 
 		 524 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.362725  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2976  hypothetical protein  52.58 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.282328  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2839  protein of unknown function DUF162  48.13 
 
 		 524 aa  421  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2616  hypothetical protein  48.13 
 
 		 524 aa  420  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597104 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5818  hypothetical protein  49.07 
 
 		 457 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  normal  0.128266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2929  hypothetical protein  47.7 
 
 		 523 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5428  protein of unknown function DUF162  47.65 
 
 		 464 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1270  protein of unknown function DUF162  47.65 
 
 		 477 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1177  putative electron transport protein  47.9 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0190009  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  40.23 
 
 		 479 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  39.2 
 
 		 463 aa  300  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  38.36 
 
 		 470 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  38.36 
 
 		 475 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  38.13 
 
 		 470 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  38.17 
 
 		 475 aa  296  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  38.17 
 
 		 475 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  38.17 
 
 		 475 aa  295  8e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  38.17 
 
 		 475 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  38.41 
 
 		 475 aa  295  8e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  38.13 
 
 		 470 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  38.13 
 
 		 470 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  39.86 
 
 		 470 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  39.67 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  37.94 
 
 		 475 aa  294  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  38.17 
 
 		 475 aa  293  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  38.17 
 
 		 475 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  38.17 
 
 		 475 aa  293  5e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  37.88 
 
 		 470 aa  292  8e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2594  protein of unknown function DUF162  39.55 
 
 		 475 aa  292  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.487179  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  36.95 
 
 		 472 aa  289  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2451  Iron-sulfur cluster binding protein  38.74 
 
 		 498 aa  289  7e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.131234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3037  protein of unknown function DUF162  38.52 
 
 		 467 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.779274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  39.12 
 
 		 470 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  37.18 
 
 		 473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  37.81 
 
 		 479 aa  285  8e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  38.03 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  39.49 
 
 		 475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  38.95 
 
 		 463 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  37.64 
 
 		 478 aa  282  7.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  38.66 
 
 		 480 aa  282  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0890  iron-sulfur cluster binding protein  37.11 
 
 		 510 aa  282  9e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  37.56 
 
 		 490 aa  282  9e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  36.7 
 
 		 470 aa  282  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  36.71 
 
 		 494 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  36.71 
 
 		 464 aa  280  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  38.3 
 
 		 476 aa  280  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  37.7 
 
 		 479 aa  279  6e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  38.02 
 
 		 490 aa  279  6e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  37.47 
 
 		 480 aa  279  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  38.13 
 
 		 484 aa  279  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  37.06 
 
 		 480 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  36.49 
 
 		 493 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  36.49 
 
 		 493 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0885  iron-sulfur cluster binding protein  38 
 
 		 474 aa  278  1e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  35.86 
 
 		 528 aa  278  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  37.85 
 
 		 475 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  39.43 
 
 		 481 aa  277  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  38.76 
 
 		 456 aa  277  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  38.34 
 
 		 482 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0968  iron-sulfur cluster binding protein  38.1 
 
 		 476 aa  276  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  37.19 
 
 		 496 aa  276  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  36.26 
 
 		 501 aa  276  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  36.36 
 
 		 478 aa  276  7e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  36.43 
 
 		 485 aa  276  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1396  hypothetical protein  40.05 
 
 		 465 aa  275  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  37.44 
 
 		 481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  37.72 
 
 		 475 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  38.98 
 
 		 473 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2721  Iron-sulfur cluster binding protein  38.68 
 
 		 471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0396  iron-sulfur cluster binding protein  38.28 
 
 		 475 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0924401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1754  iron-sulfur cluster binding protein  37.14 
 
 		 512 aa  272  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.258831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  38.98 
 
 		 473 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  38.98 
 
 		 473 aa  272  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  39.39 
 
 		 480 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  37.76 
 
 		 477 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>