More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0646 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0646  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
333 aa  689    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.473104 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1297  ABC transporter related  47.25 
 
 
357 aa  261  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.934919  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1005  ABC transporter related  43.22 
 
 
365 aa  258  8e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0737536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2251  ABC transporter related  41.09 
 
 
342 aa  258  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0163  ABC transporter-like  46.4 
 
 
333 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3089  ABC transporter related  42.24 
 
 
340 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0279  ABC transporter related  39.75 
 
 
339 aa  250  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0343631  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3338  ABC transporter related  47.12 
 
 
347 aa  248  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2112  ABC transporter related  42.41 
 
 
330 aa  225  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00532716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3496  ABC transporter-like protein  36.81 
 
 
384 aa  205  9e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0080  ABC transporter related  39.44 
 
 
258 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0342  ABC transporter related protein  36.86 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3543  ABC transporter related  40.73 
 
 
271 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0281  ABC transporter related protein  40.14 
 
 
393 aa  192  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0672  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.42 
 
 
252 aa  182  6e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.164199 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12803  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.76 
 
 
263 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  38.37 
 
 
375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5233  ABC transporter related  35.04 
 
 
268 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1258  ABC transporter related  41.52 
 
 
412 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0128  ABC transporter related  34.98 
 
 
376 aa  169  7e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15406  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.6 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.495762  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  33.11 
 
 
282 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  34.69 
 
 
282 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  34.69 
 
 
282 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  33.11 
 
 
283 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  36.67 
 
 
274 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  33.56 
 
 
283 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  37.08 
 
 
255 aa  159  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
273 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
273 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
273 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
273 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 
273 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
273 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  33.22 
 
 
282 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  36.05 
 
 
285 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24440  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  33.33 
 
 
259 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0466  ABC transporter related  36.71 
 
 
286 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 
273 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.55 
 
 
273 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.55 
 
 
273 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  34.85 
 
 
280 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  34.55 
 
 
273 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  31.68 
 
 
418 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  37.83 
 
 
271 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  34.09 
 
 
258 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.46 
 
 
625 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  34.53 
 
 
267 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4111  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
272 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1631  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.9 
 
 
296 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0942936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 
272 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.9 
 
 
296 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  32.42 
 
 
490 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.59 
 
 
272 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1188  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
296 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
296 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.59 
 
 
272 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.59 
 
 
272 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  35.9 
 
 
296 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0867  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.9 
 
 
296 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00729105  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  34.14 
 
 
536 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0294  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.9 
 
 
296 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228173  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  35.71 
 
 
281 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  34.84 
 
 
266 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  34.53 
 
 
263 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2662  ABC transporter-related protein  34.48 
 
 
265 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  35.94 
 
 
273 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  35.68 
 
 
271 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  36.71 
 
 
275 aa  149  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  34.89 
 
 
257 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  34.19 
 
 
255 aa  149  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  31.84 
 
 
265 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  31.43 
 
 
265 aa  149  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4448  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.59 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  34.32 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3732  ABC transporter related  36.52 
 
 
270 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.07 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  37.33 
 
 
260 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4500  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
272 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  35.04 
 
 
278 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  35.56 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  35.47 
 
 
277 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  33.19 
 
 
257 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2424  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 
302 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2937  ABC transporter related protein  35.27 
 
 
284 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  32.14 
 
 
292 aa  146  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  32.48 
 
 
267 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  30.16 
 
 
276 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4486  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.96 
 
 
272 aa  146  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  32.66 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34.71 
 
 
289 aa  145  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  33.63 
 
 
273 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  37.22 
 
 
339 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  34.96 
 
 
271 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  33.63 
 
 
273 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  36.41 
 
 
274 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  34.01 
 
 
284 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  33.19 
 
 
273 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1526  ABC transporter related  35.27 
 
 
283 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  33.63 
 
 
273 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>