More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0575 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0575  penicillin-binding protein 2, putative  100 
 
 
733 aa  1503    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6973  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.47 
 
 
701 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.846927  normal  0.0145645 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2746  cell division protein, penicillin-binding protein  33.47 
 
 
701 aa  382  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.777565  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3331  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.23 
 
 
697 aa  362  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3521  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.23 
 
 
714 aa  351  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681178  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06545  penicillin-binding protein  29.99 
 
 
662 aa  342  1e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0208895  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0595  hypothetical protein  31.2 
 
 
704 aa  333  5e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1805  peptidoglycan glycosyltransferase  31.82 
 
 
669 aa  325  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667457  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4738  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.61 
 
 
709 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.51 
 
 
689 aa  240  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1597  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.05 
 
 
651 aa  237  7e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0151645  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  29.61 
 
 
684 aa  228  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  29.39 
 
 
657 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.26 
 
 
657 aa  208  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.28 
 
 
660 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  26.63 
 
 
657 aa  201  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.83 
 
 
680 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  26.53 
 
 
656 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.08 
 
 
680 aa  196  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3962  penicillin-binding protein  26.38 
 
 
716 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.14 
 
 
670 aa  196  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 
737 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.02 
 
 
654 aa  193  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.97 
 
 
662 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3969  penicillin-binding protein  26.38 
 
 
699 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00715296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  26.42 
 
 
723 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3675  penicillin-binding protein  26.56 
 
 
716 aa  189  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.78 
 
 
656 aa  188  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.24 
 
 
673 aa  188  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.31 
 
 
672 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3743  peptidoglycan glycosyltransferase  25.21 
 
 
699 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3658  penicillin-binding protein  26.43 
 
 
716 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3767  penicillin-binding protein  25.65 
 
 
716 aa  185  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4055  penicillin-binding protein  25.65 
 
 
716 aa  185  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3931  penicillin-binding protein  26.34 
 
 
699 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0456911 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0049  penicillin-binding protein 3  31.53 
 
 
663 aa  183  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0588264  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1271  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.74 
 
 
730 aa  183  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0816576  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.69 
 
 
736 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  28.68 
 
 
673 aa  181  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  28.26 
 
 
657 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2431  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  25.33 
 
 
712 aa  177  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00172457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1224  penicillin-binding protein  27.32 
 
 
699 aa  177  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0433521  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  26.03 
 
 
717 aa  177  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  29.04 
 
 
708 aa  176  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4017  penicillin-binding protein  26.69 
 
 
716 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2666  penicillin-binding protein  24.93 
 
 
712 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2467  penicillin-binding protein  25.17 
 
 
712 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00794581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2717  penicillin-binding protein  25.2 
 
 
712 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2648  penicillin-binding protein  25.17 
 
 
712 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2679  penicillin-binding protein  25.33 
 
 
712 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2677  penicillin-binding protein  24.43 
 
 
712 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2634  penicillin-binding protein  24.66 
 
 
712 aa  172  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000396671 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2392  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  24.8 
 
 
712 aa  172  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  26.61 
 
 
622 aa  170  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  28.08 
 
 
589 aa  168  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.635287  normal  0.182989 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  28.11 
 
 
613 aa  168  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3955  peptidoglycan glycosyltransferase  28.12 
 
 
603 aa  167  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.194154  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  27.78 
 
 
695 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  28.88 
 
 
705 aa  167  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2488  peptidoglycan glycosyltransferase  24.84 
 
 
712 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00738321  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  26.98 
 
 
631 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  27.94 
 
 
613 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.22 
 
 
614 aa  163  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  25.13 
 
 
713 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.89 
 
 
570 aa  161  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1254  peptidoglycan glycosyltransferase  31.22 
 
 
562 aa  160  8e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  27.18 
 
 
553 aa  160  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0587  peptidoglycan glycosyltransferase  25.86 
 
 
719 aa  159  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.96 
 
 
582 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  26.57 
 
 
740 aa  159  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  27.56 
 
 
649 aa  156  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1207  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  24.47 
 
 
716 aa  156  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.222588  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  26.07 
 
 
729 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  27.58 
 
 
644 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  25.81 
 
 
653 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  25.84 
 
 
708 aa  154  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  25.47 
 
 
575 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  24.59 
 
 
721 aa  153  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.3 
 
 
645 aa  153  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0370  Peptidoglycan glycosyltransferase  23.24 
 
 
670 aa  153  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4620  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.73 
 
 
609 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1853  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.33 
 
 
624 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  28.69 
 
 
682 aa  150  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  24.43 
 
 
728 aa  150  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.25 
 
 
594 aa  149  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  29.25 
 
 
594 aa  149  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1329  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.55 
 
 
566 aa  147  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  26.86 
 
 
583 aa  146  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.93 
 
 
655 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  28.76 
 
 
671 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  27 
 
 
734 aa  146  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.12 
 
 
675 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3749  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.31 
 
 
607 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425103  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  27.58 
 
 
646 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  24.3 
 
 
708 aa  143  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1199  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.01 
 
 
612 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  29.47 
 
 
587 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  25.62 
 
 
711 aa  143  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.01 
 
 
612 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  23.68 
 
 
727 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>