130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0248 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0248  translation initation factor SUI1, putative  100 
 
 		 110 aa  226  6e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0471  translation initiation factor SUI1  54.95 
 
 		 110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4092  translation initiation factor SUI1  55.88 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2854  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  49.06 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339586  normal  0.0877983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3941  translation initiation factor SUI1  50 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3595  translation initiation factor SUI1  47.17 
 
 		 112 aa  92  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52235  normal  0.025407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3343  translation initiation factor Sui1  41.23 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1910  translation initiation factor Sui1  44.3 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3853  translation initiation factor SUI1  38.95 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3188  translation initiation factor SUI1  41.77 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00588203  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2964  translation initiation factor Sui1  37.11 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3154  translation initiation factor Sui1  37.11 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4810  translation initiation factor Sui1  39.24 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2142  translation initiation factor Sui1  43.59 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183879  normal  0.356716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1423  translation initiation factor SUI1  40.74 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1480  translation initiation factor Sui1  33.62 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1997  translation initiation factor Sui1  38.55 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1568  translation initiation factor Sui1  43.06 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01715  Sui1 family protein  34.55 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64000  translation initiation factor Sui1  38.3 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2195  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  40.28 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0976146  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0321  translation initiation factor Sui1  40.24 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1912  translation initiation factor Sui1  37.27 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000470884  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0210  translation initiation factor SUI1  40 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2237  translation initiation factor Sui1  37.27 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0294222  normal  0.0125302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2023  translation initiation factor Sui1  37.27 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.785803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4599  translation initiation factor Sui1  37 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3549  translation initiation factor SUI1  40.24 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0680444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0566  translation initiation factor Sui1  37 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0534  translation initiation factor Sui1  38.67 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0627  translation initiation factor Sui1  37.8 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.344568  normal  0.0369514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0605  translation initiation factor SUI1  37 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2203  translation initiation factor SUI1  43.08 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.513989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0726  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  39.6 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4188  translation initiation factor SUI1  35.64 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10953  putative translation initiation factor  34.41 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.788012  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5560  translation initiation factor Sui1  37.23 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0611  translation initiation factor Sui1  37 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4512  translation initiation factor SUI1  44.29 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.477068  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01259  translation initiation factor Sui1  36.36 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000686676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2365  translation initiation factor SUI1  36.36 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110904  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1443  translation initiation factor SUI1  41.67 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  normal  0.134693 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01270  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1394  translation initiation factor Sui1  36.36 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000598621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1485  translation initiation factor Sui1  36.36 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2344  translation initiation factor Sui1  36.36 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000454927  unclonable  0.000000015805 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1589  translation initiation factor SUI1  39.02 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1511  translation initiation factor Sui1  36.36 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000972273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4380  translation initiation factor Sui1  35.48 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2534  translation initiation factor Sui1  36.59 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0366  translation initiation factor Sui1  38.67 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485747  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2680  translation initiation factor Sui1  37.65 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1902  translation initiation factor Sui1  37.5 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1846  translation initiation factor Sui1  36.36 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000134227  hitchhiker  8.5212e-20 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3345  translation initiation factor Sui1  36.05 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2911  translation initiation factor Sui1  35.37 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2675  translation initiation factor Sui1  35.63 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000045449  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1201  translation initiation factor Sui1  36.05 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177618  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3018  translation initiation factor Sui1  34.48 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000751139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3033  translation initiation factor Sui1  34.48 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000199492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1830  translation initiation factor Sui1  35.45 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0277649  hitchhiker  8.595610000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1892  translation initiation factor Sui1  35.45 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000000000000626787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1835  translation initiation factor Sui1  35.45 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00136333  hitchhiker  0.000244384 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1443  translation initiation factor Sui1  35.45 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1625  translation initiation factor Sui1  35.45 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00194965  hitchhiker  4.78145e-19 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1345  translation initiation factor Sui1  34.48 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00294429  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1990  translation initiation factor Sui1  35.37 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4841  translation initiation factor SUI1, putative  35.48 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2049  translation initiation factor Sui1  36 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  9.06796e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0267  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  43.06 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2210  translation initiation factor Sui1  39.51 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000269686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0626  translation initiation factor Sui1  35.48 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3580  translation initiation factor SUI1  37.8 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1271  translation initiation factor Sui1  36.05 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000428708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2865  translation initiation factor SUI1  30.63 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3176  translation initiation factor Sui1  33.33 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00012053  hitchhiker  0.0057416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07040  translation initiation factor Sui1  36 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2851  translation initiation factor Sui1  40.28 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181646  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2059  translation initiation factor SUI1  34.62 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1338  translation initiation factor Sui1  38.89 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0446445  hitchhiker  0.000386966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2580  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  41.67 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27071  translation initiation factor SUI1  34.57 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2186  translation initiation factor Sui1  36.61 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.019439  hitchhiker  0.000338309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2838  translation initiation factor SUI1  31.53 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179746  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1504  translation initiation factor SUI1  32.65 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1592  translation initiation factor SUI1  34.65 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1200  translation initiation factor Sui1  36.05 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000764802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1133  translation initiation factor Sui1  35.23 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129077  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5669  translation initiation factor SUI1  34.31 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0636  translation initiation factor Sui1  34.95 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1917  translation initiation factor Sui1  35.45 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000003145  hitchhiker  0.00000000000000420932 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1145  translation initiation factor Sui1  32.04 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.244875  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0413  translation initiation factor Sui1  42.42 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2419  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  37.21 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1238  translation initiation factor Sui1  37.5 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.120876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1704  translation initiation factor SUI1  33.65 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00246322  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0584  translation initiation factor SUI1  35.96 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00019387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2734  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  41.43 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0717  translation initiation factor Sui1  33.75 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00154405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0413  translation initiation factor Sui1  40.91 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>