25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5615 on replicon NC_011734
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  63.64 
 
 
808 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  52.35 
 
 
606 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  57.24 
 
 
595 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  52.45 
 
 
815 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  50 
 
 
514 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.43 
 
 
638 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.56 
 
 
693 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  40.31 
 
 
643 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  39.73 
 
 
377 aa  85.5  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  36.73 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  34.97 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  33.33 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  32.37 
 
 
416 aa  63.2  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7127  hypothetical protein  37.5 
 
 
403 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  34.35 
 
 
207 aa  61.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  34.06 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  32.21 
 
 
176 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1708  surface antigen  30 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.63868  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  32.46 
 
 
152 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  33.59 
 
 
232 aa  49.7  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  32.58 
 
 
303 aa  47  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1215  membrane attack complex component/perforin/complement C9  21.03 
 
 
466 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.18029  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  32.65 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  33.33 
 
 
633 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>