44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5172 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5172  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 547 aa  1099    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00242224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0917  hydrophobic amino acid uptake ABC-transporter  50.72 
 
 		 529 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0944  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  50.36 
 
 		 529 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.910902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1306  Extracellular ligand-binding receptor  33.41 
 
 		 471 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4718  extracellular ligand-binding receptor  31.99 
 
 		 1007 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.87534 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1298  Extracellular ligand-binding receptor  33.07 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4967  Extracellular ligand-binding receptor  32.63 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2642  serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 		 795 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2131  Extracellular ligand-binding receptor  34.73 
 
 		 813 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.651568 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1267  Extracellular ligand-binding receptor  32.82 
 
 		 471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3474  serine/threonine protein kinase  32.91 
 
 		 795 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0941  serine/threonine protein kinase  32.54 
 
 		 758 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4682  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 791 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1828  extracellular ligand-binding receptor  29.25 
 
 		 512 aa  130  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2791  Serine/threonine protein kinase  26.63 
 
 		 780 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0818409  normal  0.914958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2769  extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 		 981 aa  110  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0942  serine/threonine protein kinase  31.79 
 
 		 576 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5073  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  22.99 
 
 		 599 aa  67  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  26.16 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  26.73 
 
 		 371 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  26.83 
 
 		 369 aa  53.9  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  24.58 
 
 		 382 aa  52.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3377  extracellular ligand-binding receptor  23.69 
 
 		 380 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  24.01 
 
 		 380 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  24.11 
 
 		 375 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  23.55 
 
 		 388 aa  50.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3150  extracellular ligand-binding receptor  22.62 
 
 		 382 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2048  hypothetical protein  47.62 
 
 		 416 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1892  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 422 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.130266  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2254  extracellular ligand-binding receptor  23.31 
 
 		 373 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.412845 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  25.09 
 
 		 398 aa  47  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  23.59 
 
 		 380 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0065  Extracellular ligand-binding receptor  23.21 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0178  extracellular ligand-binding receptor  22.3 
 
 		 383 aa  47  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  26.13 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.87 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  23.02 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2615  extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 		 373 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4954  extracellular ligand-binding receptor  24.91 
 
 		 376 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2975  extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.225754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 		 382 aa  44.3  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  23.56 
 
 		 368 aa  44.3  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  24.19 
 
 		 460 aa  43.9  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  30.28 
 
 		 376 aa  43.5  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>