28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5000 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5000  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1736  hypothetical protein  25.86 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2479  pilin-like protein  26.42 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209449  hitchhiker  0.0000256314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1711  type 4 prepilin-like protein  25.86 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3385  type IV pilin protein, putative  25 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1601  type 4 pilin  25.42 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.14 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  26.67 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  42.11 
 
 		 157 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  40.35 
 
 		 157 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  27.91 
 
 		 155 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  25.38 
 
 		 160 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  25.38 
 
 		 160 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  26.36 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.85 
 
 		 170 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  26.67 
 
 		 129 aa  42.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  31.34 
 
 		 163 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0271  hypothetical protein  23.67 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  26.39 
 
 		 161 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0392  hypothetical protein  32.81 
 
 		 150 aa  42.4  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  33.33 
 
 		 70 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  31.15 
 
 		 177 aa  42  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  29.51 
 
 		 201 aa  42  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.06 
 
 		 164 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0963  N-terminal methylation  30.67 
 
 		 170 aa  42  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.06 
 
 		 164 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.06 
 
 		 164 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.25 
 
 		 167 aa  41.6  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>