60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3162 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3162  FHA domain containing protein  100 
 
 
158 aa  329  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1575  FHA domain containing protein  57.64 
 
 
149 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1551  FHA domain containing protein  57.64 
 
 
149 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1812  FHA domain-containing protein  53.52 
 
 
166 aa  153  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1549  FHA domain-containing protein  50 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1378  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.54 
 
 
840 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1348  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.54 
 
 
840 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0565  FHA domain-containing protein  41.94 
 
 
220 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0649133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1939  FHA domain containing protein  42.61 
 
 
241 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4218  FHA domain containing protein  42.31 
 
 
182 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2332  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with FHA and GAF sensor  38.65 
 
 
884 aa  94.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3125  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.44 
 
 
712 aa  94  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0323  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
706 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.976803  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3662  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.06 
 
 
842 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223359  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3448  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  46.73 
 
 
696 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2656  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  46.73 
 
 
696 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with FHA and GAF sensor  35.17 
 
 
880 aa  84  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3126  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.12 
 
 
839 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0002  diguanylate cyclase  44.12 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0004  diguanylate cyclase  44.12 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0921  FHA domain containing protein  37.38 
 
 
266 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4871  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.6 
 
 
684 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0716  FHA domain containing protein  36.89 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3124  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.72 
 
 
609 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3447  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.89 
 
 
617 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2657  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.89 
 
 
617 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4189  adenylate/guanylate cyclase  35.16 
 
 
336 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0924354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0117  FHA domain-containing protein-like protein  38.89 
 
 
246 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0049  FHA domain-containing protein  37.78 
 
 
245 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.0038838  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  30 
 
 
427 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2000  penicillin-binding protein 1A  35.87 
 
 
740 aa  47.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.53 
 
 
838 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0662  LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
222 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1251  FHA domain-containing protein  35.79 
 
 
217 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0268587 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4251  adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
329 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0807757  hitchhiker  0.000000663709 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4212  adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
329 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14970  FHA domain-containing protein  31.58 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0364194  normal  0.592543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4212  FHA domain containing protein  35.37 
 
 
246 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3962  FHA domain containing protein  35.44 
 
 
201 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5252  FHA domain containing protein  36.59 
 
 
255 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.691426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2501  FHA domain-containing protein  31.31 
 
 
306 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320482  decreased coverage  0.000381992 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  33.7 
 
 
851 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2666  FHA domain-containing protein  22.63 
 
 
263 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0494  FHA domain-containing protein  34.57 
 
 
236 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0075919  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0147  FHA domain containing protein  28.04 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0024  FHA domain-containing protein  35.92 
 
 
280 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
346 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4219  Forkhead-associated protein  31.58 
 
 
224 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  29.06 
 
 
279 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13440  FHA domain-containing protein  31.25 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1259  peptidoglycan glycosyltransferase  32.26 
 
 
707 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3612  FHA domain containing protein  26.51 
 
 
514 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  hitchhiker  0.00187032 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  35.62 
 
 
245 aa  41.2  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3060  FHA domain-containing protein  36.71 
 
 
253 aa  41.2  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1775  hypothetical protein  38.03 
 
 
302 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00409515  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2875  FHA domain-containing protein  32.2 
 
 
158 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2326  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  33.75 
 
 
757 aa  40.8  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2844  FHA domain-containing protein  32.2 
 
 
158 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2888  FHA domain-containing protein  32.2 
 
 
158 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3402  FHA domain-containing protein  32.2 
 
 
183 aa  40.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10779  normal  0.511824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>