39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0354 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0354  glycerate kinase  100 
 
 
350 aa  716    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1967  hypothetical protein  56.73 
 
 
349 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136268 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1940  glycerate kinase  56.16 
 
 
349 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3799  glycerate kinase  53.39 
 
 
356 aa  350  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.390392  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1031  glycerate kinase  50.79 
 
 
334 aa  312  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  49.06 
 
 
348 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  45.56 
 
 
359 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0996  glycerate kinase  38.99 
 
 
328 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.731332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  34.63 
 
 
269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3207  hypothetical protein  29.32 
 
 
300 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  29 
 
 
325 aa  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1408  hypothetical protein  31.62 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38956  predicted protein  33.19 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.591207  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  31.34 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  30.2 
 
 
255 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3783  hypothetical protein  28.93 
 
 
326 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492167  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  30.14 
 
 
288 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41282  predicted protein  30.86 
 
 
358 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0347701  normal  0.0262315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  28.37 
 
 
371 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  28.11 
 
 
296 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00210  conserved hypothetical protein  29.3 
 
 
312 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08971  putative kinase  29.57 
 
 
315 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0840  putative kinase  30.43 
 
 
314 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0133007  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10421  putative kinase  28.68 
 
 
313 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.200002  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  30.26 
 
 
290 aa  99.8  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08991  putative kinase  30.47 
 
 
314 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.962103  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07108  conserved hypothetical protein  28.99 
 
 
321 aa  95.9  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.769324  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  26.84 
 
 
313 aa  93.2  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0509  hypothetical protein  28.94 
 
 
293 aa  92.4  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09161  putative kinase  26.77 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565148 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  29.69 
 
 
1320 aa  87.4  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  27.62 
 
 
328 aa  86.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0248  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  26.94 
 
 
336 aa  82.4  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.270225  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14561  putative kinase  26.67 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  30.47 
 
 
226 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_004310  BR0062  putative fructose transport system kinase  34.71 
 
 
232 aa  43.5  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0061  putative fructose transport system kinase  34.71 
 
 
232 aa  43.1  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0359  pantothenate kinase  27.81 
 
 
312 aa  43.1  0.007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  27.57 
 
 
319 aa  43.1  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>