33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3740 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  78.25 
 
 		 686 aa  1056    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  100 
 
 		 685 aa  1406    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1493  hypothetical protein  48.8 
 
 		 679 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0707557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1381  hypothetical protein  49.51 
 
 		 661 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0399  hypothetical protein  50.23 
 
 		 438 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719971  normal  0.0793773 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  29.54 
 
 		 626 aa  233  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2360  hypothetical protein  28.57 
 
 		 631 aa  208  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000648065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1377  hypothetical protein  29.07 
 
 		 631 aa  206  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.469999  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1492  hypothetical protein  29.11 
 
 		 631 aa  201  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1865  hypothetical protein  28.62 
 
 		 631 aa  195  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000596823 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2381  conserved hypothetical protein  28.41 
 
 		 631 aa  194  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0833441  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  27.2 
 
 		 639 aa  179  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0534  hypothetical protein  28.03 
 
 		 644 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  27.38 
 
 		 644 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  26.21 
 
 		 656 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1900  hypothetical protein  39.84 
 
 		 527 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0465  putative transmembrane signal peptide protein  24.96 
 
 		 644 aa  158  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.559326  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1926  hypothetical protein  46.73 
 
 		 239 aa  150  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0384615  normal  0.526622 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0576  putative transmembrane signal peptide protein  26.53 
 
 		 652 aa  140  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000285101  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0145  hypothetical protein  26.73 
 
 		 633 aa  140  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01254  hypothetical protein  30.51 
 
 		 438 aa  125  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3732  hypothetical protein  25.06 
 
 		 609 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0265858  normal  0.0706106 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0818  hypothetical protein  24.21 
 
 		 543 aa  55.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0165146  hitchhiker  0.0000000000172103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3926  hypothetical protein  25.71 
 
 		 360 aa  53.9  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2422  hypothetical protein  26.53 
 
 		 606 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2428  hypothetical protein  26.53 
 
 		 606 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554313  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2381  hypothetical protein  26.53 
 
 		 606 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0277  hypothetical protein  26.83 
 
 		 586 aa  52.4  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2765  hypothetical protein  21.61 
 
 		 634 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0661  hypothetical protein  22.72 
 
 		 573 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0929  hypothetical protein  22.68 
 
 		 547 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0961263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1248  Protein of unknown function DUF2207, membrane  24.49 
 
 		 652 aa  46.2  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2301  hypothetical protein  19.26 
 
 		 676 aa  43.9  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>