More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2358 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2358  aldo/keto reductase  100 
 
 		 305 aa  634    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2632  aldo/keto reductase  95.41 
 
 		 305 aa  610  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664851  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1709  aldo/keto reductase  73.11 
 
 		 305 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1742  aldo/keto reductase  71.8 
 
 		 305 aa  484  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2256  aldo/keto reductase  65.57 
 
 		 305 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3220  aldo/keto reductase  62.95 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0776  aldo/keto reductase  61.31 
 
 		 304 aa  408  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000474987  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0133  oxidoreductase  64.38 
 
 		 303 aa  409  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2205  aldo/keto reductase  55.08 
 
 		 305 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0717113  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1681  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.82 
 
 		 304 aa  361  9e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0752953  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1374  aldo/keto reductase  55.02 
 
 		 308 aa  358  8e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0172  aldo/keto reductase  51.74 
 
 		 317 aa  343  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000355208  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1627  aldo/keto reductase  54.37 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01900  predicted oxidoreductase  53.38 
 
 		 311 aa  338  7e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3380  aldo/keto reductase  52.26 
 
 		 310 aa  331  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0022  oxidoreductase  47.76 
 
 		 348 aa  328  7e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00128895  normal  0.715289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0091  aldo/keto reductase  51.77 
 
 		 311 aa  326  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.198362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4599  aldo/keto reductase  51.13 
 
 		 309 aa  318  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1782  oxidoreductase  47.81 
 
 		 320 aa  311  1e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0544  putative oxidoreductase  49.06 
 
 		 319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0199  aldo/keto reductase  43.83 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1683  aldo/keto reductase  43.67 
 
 		 326 aa  235  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1373  aldo/keto reductase  38.91 
 
 		 325 aa  222  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4920  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.98 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.531098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0816  aldo/keto reductase  34.84 
 
 		 323 aa  202  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2745  aldo/keto reductase  37.46 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3037  aldo/keto reductase  38.49 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00680  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  34.98 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4106  aldo/keto reductase  35.05 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1627  aldo/keto reductase  35 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2385  aldo/keto reductase  32.8 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1789  aldo/keto reductase  33.23 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.570855  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3721  aldo/keto reductase  35.23 
 
 		 296 aa  169  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00369702  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1848  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.5 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0186711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1882  aldo/keto reductase  33.12 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2625  aldo/keto reductase  36.3 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1878  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.5 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.863433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1832  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.5 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2055  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.5 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2020  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.5 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3287  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.19 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2022  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.19 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000475  oxidoreductase aldo/keto reductase 2 family  36.39 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3147  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.19 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.157643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3405  aldo/keto reductase  33.86 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.618681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0559  aldo/keto reductase  34.9 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0442  aldo/keto reductase  33.9 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2133  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.19 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1536  oxidoreductase YdhF  33.76 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1942  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2100  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.19 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06230  oxidoreductase  36.03 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3470  aldo/keto reductase  34.78 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1735  oxidoreductase YdhF  33.44 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0714  aldo/keto reductase  34.52 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1904  oxidoreductase YdhF  33.44 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0560  aldo/keto reductase  34.56 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1549  oxidoreductase YdhF  33.12 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1609  oxidoreductase YdhF  33.12 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0519  aldo/keto reductase  35.09 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000489945  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0378  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.85 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1235  aldo/keto reductase  32.57 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3361  aldo/keto reductase  32.29 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308056 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3805  aldo/keto reductase  35.09 
 
 		 296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000679515  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3749  aldo/keto reductase  35.09 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.759782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0728  aldo/keto reductase  34.48 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3385  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.02 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3931  aldo/keto reductase  34.74 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0712  aldo/keto reductase  34.48 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2208  aldo/keto reductase  33.44 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127035  hitchhiker  0.000128272 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01617  predicted oxidoreductase  32.48 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000132879  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1993  aldo/keto reductase  32.48 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748475  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1551  oxidoreductase YdhF  32.48 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0142361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1724  oxidoreductase YdhF  32.48 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5132  aldo/keto reductase  31.73 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01607  hypothetical protein  32.48 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000961998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1858  oxidoreductase YdhF  32.15 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0852193  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1766  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.55 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000117782  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2561  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.55 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1875  aldo/keto reductase  34.55 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000512322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1982  aldo/keto reductase  32.48 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00479924  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0467  putative aldo/keto reductase  31.68 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1800  aldo/keto reductase  32.15 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000028572  normal  0.0307489 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1839  oxidoreductase YdhF  32.15 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4340  aldo/keto reductase  32.91 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.898707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2444  aldo/keto reductase  32.26 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02170  oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein  29.21 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0441088  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1601  aldo/keto reductase  26.28 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03960  predicted oxidoreductase  30.13 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.784363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1661  aldo/keto reductase  30.32 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2756  aldo/keto reductase  32.03 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0248863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  28.83 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  30.03 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2535  aldo/keto reductase  30.12 
 
 		 329 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00875609  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  32.02 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3140  aldo/keto reductase  30.1 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179796  hitchhiker  0.00689502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  26.22 
 
 		 342 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3311  aldo/keto reductase  29.47 
 
 		 322 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4504  aldo/keto reductase  29.58 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0157031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.82 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>