164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1530 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2412  peptidase T  83.46 
 
 		 416 aa  689    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1530  peptidase T  100 
 
 		 411 aa  849    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1976  peptidase T  74.08 
 
 		 409 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.371679  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0680  peptidase T  73.66 
 
 		 410 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3359  peptidase T  74.08 
 
 		 410 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2931  peptidase T  97.56 
 
 		 409 aa  813    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2506  peptidase T  81.91 
 
 		 413 aa  706    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0749  peptidase T  73.84 
 
 		 410 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3612  peptidase T  65.93 
 
 		 407 aa  554  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0032561  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5042  peptidase T  64.68 
 
 		 414 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.918686 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5411  peptidase T  65.17 
 
 		 414 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.683579  normal  0.180292 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0166  peptidase T  54.75 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0801  peptidase T  53.77 
 
 		 406 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  46.06 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1115  peptidase T  46.6 
 
 		 418 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2074  peptidase T  41.63 
 
 		 409 aa  342  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1206  peptidase T  41.77 
 
 		 414 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.44823  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1377  peptidase T  42.08 
 
 		 410 aa  333  2e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0800  peptidase T  41.44 
 
 		 407 aa  334  2e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  39.9 
 
 		 410 aa  325  7e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  41.38 
 
 		 411 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  41.28 
 
 		 415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3224  peptidase T  42.93 
 
 		 410 aa  319  6e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.525906  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09630  peptidase T  41.4 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  41.6 
 
 		 414 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  40.79 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1193  peptidase T  42.93 
 
 		 409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0029  peptidase T  39.31 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0029  peptidase T  39.56 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2411  peptidase T  38.93 
 
 		 410 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.825579  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1942  peptidase T  41.24 
 
 		 417 aa  300  2e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.366024  normal  0.129304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2205  peptidase T  39.51 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3512  peptidase T  38.37 
 
 		 410 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3500  peptidase T  38.02 
 
 		 412 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3791  peptidase T  37.87 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3754  peptidase T  38.12 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000202819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1456  peptidase T  37.38 
 
 		 410 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103305 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1057  peptidase T  37.97 
 
 		 402 aa  290  3e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3843  peptidase T  37.62 
 
 		 410 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3775  peptidase T  37.62 
 
 		 410 aa  290  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.524729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3488  peptidase T  37.62 
 
 		 410 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.25106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3588  peptidase T  37.87 
 
 		 410 aa  288  9e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3872  peptidase T  37.87 
 
 		 410 aa  288  9e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  39.46 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4149  peptidase T  39.61 
 
 		 410 aa  285  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  38.48 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  38.48 
 
 		 410 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  37.01 
 
 		 422 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05384  peptidase T  38.05 
 
 		 413 aa  277  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0445  peptidase T  39.46 
 
 		 405 aa  276  4e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0466341 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  37.96 
 
 		 423 aa  276  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  36.95 
 
 		 408 aa  276  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  36.95 
 
 		 408 aa  276  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  36.95 
 
 		 408 aa  276  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  36.95 
 
 		 408 aa  276  7e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  36.95 
 
 		 408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1996  peptidase T  38.41 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  36.95 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  36.95 
 
 		 422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  36.95 
 
 		 422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  36.95 
 
 		 408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000506  tripeptide aminopeptidase  38.63 
 
 		 412 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0925  peptidase T  37.56 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000393366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2148  peptidase T  37.01 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0155  peptidase T  39.45 
 
 		 420 aa  269  5e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  36.27 
 
 		 409 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  37.23 
 
 		 423 aa  266  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1712  peptidase T  36.27 
 
 		 411 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0399  peptidase T  36.3 
 
 		 409 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.168902  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0648  peptidase T  37.56 
 
 		 415 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0772  peptidase T  37.65 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.340472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1605  peptidase T  36.27 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.888107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2858  peptidase T  36.27 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1652  peptidase T  35.79 
 
 		 425 aa  264  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0264694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4006  peptidase T  37.62 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000311965 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3349  peptidase T  34.33 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0105753  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  38.6 
 
 		 410 aa  259  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1922  peptidase T  37.31 
 
 		 411 aa  259  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1957  peptidase T  36.27 
 
 		 409 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.355866  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1306  peptidase T  36.27 
 
 		 409 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.841149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2139  peptidase T  36.03 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.359418  normal  0.0575573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1328  peptidase T  36.27 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.245439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1344  peptidase T  36.27 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.595235 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1389  peptidase T  37.04 
 
 		 406 aa  256  5e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0424518  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1893  peptidase T  36.01 
 
 		 417 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  37.11 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  36.48 
 
 		 408 aa  254  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2396  peptidase T  36.27 
 
 		 427 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0937974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  35.54 
 
 		 418 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6760  peptidase T  35.58 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2890  peptidase T  35.84 
 
 		 430 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.223061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  36.5 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5848  peptidase T  35.42 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0748  peptidase T  34.86 
 
 		 416 aa  247  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1094  peptidase T  38.06 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.357945  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  35.59 
 
 		 417 aa  243  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0410  peptidase T  37.07 
 
 		 412 aa  243  6e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.88832  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0767  peptidase T  36.14 
 
 		 408 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0758146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0784  peptidase T  36.14 
 
 		 408 aa  241  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0685996  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2224  peptidase T  33.41 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>