50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_15681 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_15681  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  217  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119235  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15831  hypothetical protein  91.89 
 
 
111 aa  204  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1470  hypothetical protein  89.09 
 
 
120 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00332173  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15461  hypothetical protein  69.37 
 
 
111 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304816  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1521  hypothetical protein  39.6 
 
 
100 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0995988  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03531  hypothetical protein  34.65 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  35.11 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  32.73 
 
 
117 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  32.73 
 
 
117 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  36.67 
 
 
393 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  28.83 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0275  hypothetical protein  28.1 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.560646  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  22.88 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  22.03 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  37.25 
 
 
200 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  35.37 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2212  hypothetical protein  32.26 
 
 
183 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00418947  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  27.62 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  30.61 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  24.07 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  27.19 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  25.23 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  29.47 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  29.59 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  29.47 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  26.09 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  28.42 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1691  hypothetical protein  23.33 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.554195  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  30.19 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  31 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  25.64 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  28.32 
 
 
143 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0933  hypothetical protein  60.61 
 
 
173 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00253328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  23.2 
 
 
156 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  25.25 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  25.25 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  27.27 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  25.25 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  30.21 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  27.27 
 
 
121 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  27.27 
 
 
128 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  27.27 
 
 
121 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  27.27 
 
 
121 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  27.27 
 
 
121 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  27.27 
 
 
128 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  23.71 
 
 
125 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  27.27 
 
 
128 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  27.27 
 
 
121 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  27.27 
 
 
121 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  28.57 
 
 
386 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>