28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2212 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2212  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  359  1e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00418947  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1038  hypothetical protein  41.25 
 
 		 441 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000431275  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0275  hypothetical protein  36.79 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.560646  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0196  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.667333  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  32.65 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0933  hypothetical protein  31.68 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00253328  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1521  hypothetical protein  38.95 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0995988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  34.78 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  32.53 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1470  hypothetical protein  35.48 
 
 		 120 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00332173  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2412  hypothetical protein  28.79 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2367  hypothetical protein  28.79 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0868  hypothetical protein  30.94 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03531  hypothetical protein  37.08 
 
 		 106 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4184  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.150084  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15831  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15681  hypothetical protein  32.26 
 
 		 111 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119235  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0934  hypothetical protein  29.79 
 
 		 308 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0737095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  32.12 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  31.69 
 
 		 166 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15461  hypothetical protein  27.96 
 
 		 111 aa  44.7  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304816  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1321  hypothetical protein  26.75 
 
 		 263 aa  44.7  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  23.84 
 
 		 393 aa  44.3  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1195  hypothetical protein  25.23 
 
 		 370 aa  43.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  27.93 
 
 		 116 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  30 
 
 		 121 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  36.05 
 
 		 131 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  33.33 
 
 		 125 aa  42  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>