155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0131 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0131  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  599  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822942  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  39.85 
 
 		 543 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  43.04 
 
 		 572 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  41.79 
 
 		 531 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  42.97 
 
 		 551 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  41.7 
 
 		 551 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  41.7 
 
 		 551 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  41.7 
 
 		 551 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  41.7 
 
 		 553 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  41.51 
 
 		 539 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  41.51 
 
 		 539 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62020  paraquat-inducible protein B-like protein  36.61 
 
 		 768 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0157201 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  41.51 
 
 		 539 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  41.7 
 
 		 551 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  41.7 
 
 		 551 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  41.7 
 
 		 551 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  40.85 
 
 		 539 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  40.21 
 
 		 539 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  40.21 
 
 		 539 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  38.97 
 
 		 552 aa  193  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5396  hypothetical protein  36.22 
 
 		 768 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  40.99 
 
 		 551 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  40.49 
 
 		 539 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  40.37 
 
 		 548 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  40.08 
 
 		 533 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  39.29 
 
 		 552 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6816  paraquat-inducible protein B'  39.92 
 
 		 556 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  39.29 
 
 		 552 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  38.44 
 
 		 546 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36020  paraquat-inducible protein B  37.15 
 
 		 767 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000370976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  42.34 
 
 		 551 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  41.27 
 
 		 546 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  41.06 
 
 		 539 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5278  hypothetical protein  41.83 
 
 		 531 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  38.78 
 
 		 547 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  38.52 
 
 		 531 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  41.13 
 
 		 539 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  40.87 
 
 		 546 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1772  hypothetical protein  35.21 
 
 		 878 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.91737  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4780  hypothetical protein  34.51 
 
 		 767 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0797853 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1898  Mammalian cell entry related domain protein  34.46 
 
 		 879 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0890151  normal  0.35094 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1667  hypothetical protein  34.83 
 
 		 878 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.479229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1742  hypothetical protein  34.83 
 
 		 878 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.893513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  39.15 
 
 		 544 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2453  hypothetical protein  34.46 
 
 		 879 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.552902  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2446  hypothetical protein  34.46 
 
 		 879 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000190027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2566  hypothetical protein  34.46 
 
 		 879 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.830034  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4563  hypothetical protein  36.4 
 
 		 766 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.816323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1015  hypothetical protein  35.69 
 
 		 767 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.428496  normal  0.236638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  37.99 
 
 		 546 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0640  hypothetical protein  35.83 
 
 		 769 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591879  normal  0.219756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0599  hypothetical protein  35.83 
 
 		 766 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  40.48 
 
 		 546 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  35.71 
 
 		 559 aa  178  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  38.93 
 
 		 534 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  37.31 
 
 		 559 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2208  hypothetical protein  34.46 
 
 		 881 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1704  hypothetical protein  34.15 
 
 		 554 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1849  Mammalian cell entry related domain protein  34.16 
 
 		 880 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.608446  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0645  hypothetical protein  35.04 
 
 		 769 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122805 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  38.13 
 
 		 555 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2137  Mammalian cell entry related domain protein  34.75 
 
 		 880 aa  176  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726628  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003028  paraquat-inducible protein B  36.99 
 
 		 548 aa  175  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42450  hypothetical protein  36.13 
 
 		 771 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02851  hypothetical protein  37.61 
 
 		 548 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  41.29 
 
 		 537 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2606  PqiB family protein  36.4 
 
 		 869 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2489  virulence factor MCE-like protein  33.71 
 
 		 874 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.336956  normal  0.349105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2078  Mammalian cell entry related domain protein  36.25 
 
 		 876 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.858989  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  38.49 
 
 		 508 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1920  hypothetical protein  36.36 
 
 		 554 aa  172  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.976156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1716  hypothetical protein  33.71 
 
 		 883 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.122105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  39.51 
 
 		 545 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  38.04 
 
 		 550 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  38.04 
 
 		 550 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  38.04 
 
 		 550 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  36.19 
 
 		 537 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1865  hypothetical protein  35.97 
 
 		 554 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0867784 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2113  hypothetical protein  35.97 
 
 		 554 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.696493  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  35.91 
 
 		 556 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1746  paraquat-inducible protein B  40 
 
 		 548 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  decreased coverage  0.000000731619 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1352  paraquat-inducible protein B  35.63 
 
 		 547 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273869  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  36.19 
 
 		 559 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  35.14 
 
 		 558 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1841  Mammalian cell entry related domain protein  35.38 
 
 		 876 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2562  hypothetical protein  39.37 
 
 		 558 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0758211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  37.7 
 
 		 548 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  37.69 
 
 		 547 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2234  hypothetical protein  32.59 
 
 		 881 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788365  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1282  mce-related protein  36.11 
 
 		 877 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000164876  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2050  mce-related protein  36.11 
 
 		 877 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1988  mce-related protein  36.11 
 
 		 879 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1992  mce-related protein  36.11 
 
 		 879 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1353  mce-related protein  34.98 
 
 		 879 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0226456  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1925  mce-related protein  34.98 
 
 		 879 aa  165  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00368027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2063  mce-related protein  34.98 
 
 		 879 aa  165  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0411122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01805  hypothetical protein  34.98 
 
 		 877 aa  165  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.877807  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01793  hypothetical protein  34.98 
 
 		 877 aa  165  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1798  hypothetical protein  34.98 
 
 		 877 aa  165  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604041  normal  0.0674591 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2567  mce-related protein  34.98 
 
 		 879 aa  165  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>